Data Estelar: Desconhecida A Capitã Janeway leva sua busca de vingança contra o Capitão Ransom da USS Equinox ao extremo quando ela ordena o uso de torpedos fótonicos contra a Equinox, aprisiona com o raio trator um nave neutra, quase mata um tripulante da Equinox durante um interrogatório, e dispensa Chakotay de suas funções, quando ele a questiona. Entretanto, Cap. Ransom luta com as implicações morais de suas ações, enquanto o Doutor, re-programado pela tripulação da Equinox, opera a Sete de Nove para recuperar informações de seu cérebro. Depois da destruição da nave, os cinco sobreviventes são incorporados a tripulação da Voyager.

Data Estelar: 53049.2 A Voyager está atracada em um posto avançado Markonian. Sete se repara com uma tecnologia Borg e a trás a bordo, porém começa a vivenciar lembrança como drone. Após uma tentativa de invasão por ex-borgs da mesma Unimatrix, Sete vai parar na enfermaria. A ex-Borg os identifica como Dois de Nove, Três de Nove e Quatro de Nove, e estão interligados telepaticamente e desejam quebrar esse elo.

Data Estelar: Desconhecida A Engenheira B'Elanna Torres embarca em uma jornada para o inferno Klingon, em uma experiência de quase-morte. Depois de ver sua mãe lá, B'Elanna arrisca sua própria vida para voltar e regatá-la, mesmo que isso custe a sua própria alma.

Data Estelar: Desconhecida O Doutor se programa para vivenciar sonhos, mesmo que acordado. Uma Alienígena na tentativa de espionar a USS Voyager acaba acessando o Programa do Doutor, mas, erroneamente, acaba visualizando o seu novo programa de "sonhar acordado", confundindo com a realidade dentro da Voyager.

Data Estelar: Desconhecida Tom Paris convence o Com. Chakotay a comprar uma nave avariada num lixão espacial e, ao tentar consertá-la e sua nova interface bio-neural, tem sua mente dominada pela nave chamada de Alice. Ela convence o plioto a deixar a USS Voyager a fim de voltar para um região volátil do Espaço.

Data Estelar: 53263.2 Tuvok é atacado por um misterioso alienígena e sofre danos neurológicos, como a perda de memória e começa a desenvolver uma nova personalidade, demonstrando inclusive emoções e tornando-se amigo de Neelix.

Data Estelar: 53167.9 A USS Voyager se encontra em perigo quando entra no território dos Turei. A nave consegue pousar em um planeta inabitado para se esconder e fazer reparos. Em uma caverna no subsolo, eles descobrem e revivem os últimos sobreviventes de Vaadwaur, a civilização original do planeta, que está estagnada há 900 anos. Enquanto a Voyager e seus novos aliados se preparam para enfrentar os Turei, há indícios que mostram que os Vaadwaur podem ser mais perigosos do que parecem.

Data Estelar: 53292.7 A USS Voyager encontra uma antiga nave espacial, perdida pela Humanidade numa das primeiras missões tripuladas para Marte. Curiosidade: O episódio, que foi exibido pela primeira vez em Novembro de 99, é um tributo ao 30º aniversário da chegada do Homem à Lua.

Data Estelar: Desconhecida Sete de Nove investiga um enorme "conspiração" envolvendo a Federação, os Cardassianos, o Guardião e inúmeras outras raças alienígenas, o que a princípio, indica que a USS Voyager foi deliberadamente lançada no Quadrante Delta. Na verdade, Sete modificou sua alcova para obter mais informações do que ela poderia processar, levando ela a propor perturbadoras teorias de conspiração.

Data Estelar: Desconhecida O Tenente Barclay procura a Conselheira Deanna Troi para ajuda-lo, quando ele percebe, que se tornou obcecado pelo Projeto do Comando Estelar, para contactar a USS Voyager no quadrante Delta. E apesar de toda confusão na cabeça de Barclay ele consegue o primeiro contato com a Voyager através de uma micro Fenda Espacial que está colapsando. Curiosidades: Esta foi a primeira vez que o Quartel General da Frota Estelar foi mostrado após o ataque dos Breens a São Francisco durante as últimas semanas da Guerra contra o Dominion em 2375. A maior parte da cidade, incluindo a Ponte Golden Gate, já tinha sido reconstruída naquele momento.

Data Estelar: Desconhecida Como uma violenta onda neutrônica desabilitou os motores de dobra da USS Voyager, a Capitã Janeway junta-se ao resto da tripulação para passar o tempo no programa "Fair Haven" rodado no holodeck e elaborado por Tom Paris. Dentro da pitoresca vila irlandesa, ela se encontra cada vez mais apaixonada pelo atendente do bar holográfico, Michael Sullivan.

Data Estelar: Desconhecida Este episódio mostra um planeta em que o tempo passa em um piscar de olhos, interagindo com o resto do universo, e em particular, com a USS Voyager. Não se trata especificamente de uma viagem no tempo, mas algo relacionado a como a linha temporal que transcorre em velocidades diferentes e suas inter-relações.

Data Estelar: 53556.4 O Doutor vive momentos de fama repentina, quando o seu talento é descoberto por uma raça de tecnologia superior. A sua fama faz com que ele considere sair da nave para viver no planeta alienígena, sendo adorado por milhares de fãs. Porém a fama é algo que pode desaparecer de uma hora para outra.

Data Estelar: Desconhecida Chakotay, Paris, Kim e Neelix retornam no Delta Flyer para a USS Voyager após uma longa missão avançada. Estes tripulantes da USS Voyager inexplicavelmente começam a ter horríveis "flashbacks" de uma atrocidade que ocorreu a 300 anos atrás. Estas memórias foram implantadas por um Monumento ao Massacre dos Nakans, para que o episódio nunca fosse esquecido.

Data Estelar: 53447.2 Sete de Nove e Tuvok são abduzidos por um inescrupuloso promotor de lutas. O restante da tripulação da Voyager se diverte acompanhando o Tsunkatse, um esporte popular e sangrento entre os Norcadianos. Agora Sete de Nove é forçada a lutar nessa competição até a morte.

Data Estelar: Desconhecida Sete de Nove deve negociar a liberação de um grupo avançado capturado por um cubo Borg avariado e comandado apenas um grupo juvenil zangões, liderados por um imprevisível adolescente que acredita que a coletividade voltará a re-assimilá-los. Curiosidade: Este episódio marca o início da participação do ex-Borg Icheb na Série, ele irá se tornar um novo membro da tripulação em breve.

Data Estelar: Desconhecida Os habitantes da cidade de Fair Haven, um programa criado no holodeck, vêem a tripulação da Voyager fazendo uso de tecnologia avançada e suspeitam que a equipe têm poderes místicos.

Data Estelar: 53679.4 A alferes Lyndsay Ballard falecida na data estelar 51563 retorna a USS Voyager após ser ressuscitada por um misterioso alienígena Kobali. Ballard tem esperanças de retomar sua antiga vida a bordo da Voyager, no entanto, sua família Kobali chega para reclamar sua presença.

Data Estelar: Desconhecida O Ex-menino Borg Icheb tenta retornar ao convívio com seus país no Planeta Natal Brunali. Porém o objetivo dos pais do garoto é usá-lo como arma secreta para uma vingança contra os Borg, mesmo que o plano cause a morte do garoto. Paralelamente os gêmeos Borgs quiseram clonar Naomi para um projeto de ciências que Sete de Nove tinha solicitado. Porém ela mesma sugeriu que devessem começar com o algo menor. Assim com batatas e não humanos.

Data Estelar: 53753.2 Quando três tripulantes começam a ter problemas de baixa eficiência em suas funções, A Capitã Janeway decide dar-lhes uma atenção especial e os convoca para uma missão avançada em conjunto.

Data Estelar: 53849.2 Um trio de artistas do Quadrante Delta personificam a Capitã Janeway, Tuvok, e Chakotay da nave USS Voyager para tentar roubar dinheiro e recursos minerais de vítimas inocentes.

Data Estelar: 53896.0 A Ten. Torres e o Alferes Kim, devido a um acidente com o Delta Fyler, vão parar em um planeta pré-industrial. Torres acaba involuntariamente inspirando um poeta a escrever uma peça de teatro sobre a tripulação da USS Voyager, que poderá impedir uma guerra no planeta.                     

Data Estelar: Desconhecida Em 2376 Kes retorna a USS Voyager, e em uma atitude agressiva, se dirige a Engenharia. Utilizando a energia do núcleo de dobra da Voyager, uma transtornada Kes viaja no tempo para um período cinco anos no passado, logo após a Voyager chegar ao Quadrante Delta. Sua intenção é destruir todos a bordo Voyager e fazer a Kes desse período voltar a viver em seu planeta natal. Ela está decepcionada com sua vida depois que deixou a USS Voyager e culpa Janeway e sua tripulação de a incentivar a desenvolver suas habilidades mentais. A Capitã Janeway do passado consegue matar a Kes do futuro. Quando a Kes do passado se recupera, Janeway pede sua ajuda para impedir que algo terrível lhe aconteça no futuro.

Data Estelar: Desconhecida O Projeto Pathfinder da Frota consegue estabelecer uma comunicação com a USS Voyager, através do MIDAS Array e um pulsar cíclico que amplifica o sinal, a cada 32 dias. O Doutor holográfico acaba sendo enviado para o quadrante Alfa para curar o criador do seu programa, Lewis Zimmerman, que está morrendo. O famoso inventor está recusando ser tratado e Reginald Barclay e a Conselheira Deanna Troi acreditam que o HME pode convencê-lo a aceitar o tratamento.

Data Estelar: Desconhecida A USS Voyager tem uma pane de energia e o ciclo de regenaração das crianças Borg, é interrompido. Para mantê-las entretidas, Neelix conta para as crianças a história de uma aventura assustadora vivida pelos tripulantes da Voyager, de quando eles estavam em uma certa seção do Deck 12, que é fora dos limites, e de como as criaturas que lá vivem entraram a bordo e amaldiçoaram a nave.

Data Estelar: Desconhecida Durante sua regeneração Sete de Nove é levada para um lugar chamado Unimatriz Zero. Lá, alguns poucos Borgs, podem ser indivíduos por um curto período de tempo, durante sua regeneração. Enquanto isso, a Rainha Borg pretende acabar com esse ultimo traço de individualidade dentro da coletividade.