Data Estelar: 48975.1 A USS Voyager se depara com ferrugem e gasolina em pleno espaço profundo. O que é altamente improvável. Curiosos, resolvem investigar a origem, quando se deparam com uma antiga camionete movida a gasolina, oriunda da Terra, por volta da década de trinta, no século XX. Em seguida eles captam um SOS em Código Morse e partem para o planeta de origem. Lá, além de um velho avião bimotor, eles se deparam com 8 pessoas em suspensão criogênica. Ao reviverem-nos, descobre-se que eles foram abduzidos da Terra em 1937, e que eles estavam sendo mantidos preservados por uma comunidade de mais de 100 mil humanos que eram descendentes de 200 pessoas abduzidas da Terra para trabalharem como escravos. Curiosidades: Neste episódio é apresenta uma das características marcantes das naves da Classe Intrepid, a de pousar em planetas classe "M".

Data Estelar: 49005.3 Durante um saída com uma nave auxiliar, Chakotay realiza uma cerimônia de aniversário pela morte de seu pai. Mas sem saber, ele entra em uma área dominada por um clã kazon. Um jovem neófito é mandado em uma missão para destruir Chakotay, como forma de iniciação e conquista de seu nome. Mas Chakotay destrói a sua nave e salva sua vida. Isto é uma grande vergonha para um guerreiro kazon. A nave mãe os captura, mas Chakotay foge junto com o garoto kazon, para a superfície de um planeta de treinamento. A Voyager chega para o resgate e tem que lidar com várias alternativas simultaneamente, para salvar Chakotay sem iniciar um novo combate.

Data Estelar: 48892.1 O Doutor é acionado na enfermaria para descobrir que é o único à bordo da Voyager, vitimada por um ataque, e todos abandonaram a nave. Logo depois ele se depara com B'Elanna, ao examiná-la o tricorder não registra nada. Em seguida ele é projetado na ponte, e encontra Janeway, mas o tricorder também nada registra. Por fim ele é informado pelo Ten Barclay, que na verdade ele é o verdadeiro Dr. Zimmerman, preso em uma simulação do holodeck. A partir deste ponto o Doutor passa a viver um dilema, seria ele realmente um ser vivo, e tudo o que a Voyager passou, não seria mais que um sonho? Ele seria um holograma e o Ten. Barclay seria um alienígena tentando destruir a Voyager? Ou há uma terceira opção? Curiosidades: O Ten. Barclay reaparece neste episódio, mas ele é originalmente um dos membro da tripulação da Enterprise D, de acordo com os episódios "Existência vazia", "O enésimo grau", "Reino do medo" e "Navio na garrafa" da Série Nova Geração. Nas outras temporadas de Voyager ela voltará a aparecer como engenheiro da Frota Estelar.

Data Estelar: 48921.3 Ao se depararem com um nuvem no espaço, eles descobrem que na realidade é uma colônia de seres que vivem em pleno vácuo. Ao se aproximarem são pegos pelos seres em um ciclo de acasalamento. As emanações sexuais da colônia induz Kes ao "elogium" o seu período fértil, que na sua espécie só ocorre uma vez na vida por volta dos quatro anos, mas Kes tem apenas dois anos de idade. Agora ela deve resolver se engravida com Neelix ou perde sua única oportunidade.

Data Estelar: 49011.0 Harry acorda na Terra ao lado de sua namorada. Tentando entender o que ocorreu, ele descobre que a USS Voyager está perdida, e que Tom Paris não faz parte da tripulação. Um alienígena explica a Harry que ele penetrou em um feixe temporal em seu retorno para a Voyager, e houve uma ruptura no contínuo espaço-tempo, provocando aquela distorção. Harry, então elabora uma teoria, na qual ele deve tentar encontrar um outro feixe temporal para poder regressar ao normal. Paris o ajuda na tentativa.

Data Estelar: Desconhecida Kes está aniversariando, e durante as festividades a USS Voyager se depara com um fenômeno que provoca distorções na malha espaço tempo. Estas distorções estão modificando a nave e misturando os decks. Todos estão perdidos ou desaparecidos, e quanto mais fazem para reparar a situação, mais se agrava. Por fim o fenômeno desaparece mas Janeway acredita que tudo o que ocorreu era uma entidade tentando entrar em contato com a Voyager.

Data Estelar: 49068.5 Paris está apaixonado por Kes, e Neelix está se corroendo de ciúmes. As provisões alimentares da Voyager estão em 30%, e há carências de proteínas. O setor de astronomia descobre um planeta classe M, e parece conter aminoácidos e proteínas na superfície. Ironia do destino coloca Paris e Neelix juntos nesta missão, mas ao chegar ao planeta eles caem e a nave fica destruída, o transporte não pode ser usado, e eles encontram um ninho, aonde um filhote de uma espécie reptílica acaba de quebrar o ovo, e a mãe deve voltar logo.

Data Estelar: Desconhecida Ao penetrar no espaço de uma civilização xenofóbica, Janeway começa a sofrer de ilusões, e logo todos na Voyager começam a ter ilusões que os tiram completamente do contato com a realidade. A única a ficar imune por mais tempo é Kes, que consegue descobrir um intruso à bordo e o desabilita. Somente então a tripulação se liberta das ilusões e Janeway ameaça o invasor de prisão, mas ele se revela com poderes muito acima das expectativas de todos e ao desaparecer leva com ele mais 3 naves que no momento mantinham a Voyager cercada.

Data Estelar: Desconhecida Ao procurarem um minério que é usado para selar os reatores da Voyager, Chakotay descobre um símbolo que ele viu em sua juventude e é parte do passado de sua tribo. Eles seguem os rastros de uma nave com capacidade de dobra até um determinado planeta, onde se deparam com vários problemas, mas Chakotay lembrando em flashbacks consegue decifrar a charada e se encontra com o povo que deu origem à sua tribo e a toda a sua mitologia. Eles, no fim, ajudam parcialmente a Voyager e os humanos partem em sua viagem.

Data Estelar: 49164.8 Em determinado momento da viagem os restos mortais do ser conhecido como 'Guardião' começa a apresentar estranhas vibrações. Janeway se lembra das palavras do Guardião ao mencionar que havia uma companheira dele em viagem pela Galáxia. Eles chegam a uma estação semelhante, mas menor, à do Guardião, mas está habitada por ocampas. E Kes consegue estabelecer relações com o líder dos ocampas. Mas enquanto a Voyager tenta ter acesso ao outro ser, os ocampas pretendem levar Kes com eles e entregar a Voyager para o outro guardião destruí-la.

Data Estelar: 49208.5 Naves kazons atacam a Voyager e conseguem penetrar os escudos. Eles roubam um componente do teletransporte. Logo a seguir Seska se revela e instiga Chakotay. Se sentindo responsável pelas ações de Seska, Chakotay pega uma nave auxiliar e parte em direção à frota kazon. Ao destruir o equipamento roubado, Chakotay é capturado e torturado pelos kazons. Janeway vai em busca de resgatar Chakotay, mas acaba raptando os líderes dos clãs e os troca pela liberdade de Chakotay. Seska informa a Chakotay que ele é o pai do filho dela.

Data Estelar: Desconhecida Janeway, Tuvok, Nelix e Torres estão na superfície do planeta de uma civilização dominada por um sistema militarizado. Na busca de componentes para suprir as falhas nos reatores de dobra, Torres e Tuvok acabam sendo capturados. Janeway perde o seu comunicador e a Voyager não consegue contatá-la. Em duas ações simultâneas a Voyager, sob ataque, e Janeway tentam resgatar Tuvok e Torres.

Data Estelar: Desconhecida A tripulação transporta à bordo uma entidade robótica desativada. Torres como um desafio pessoal, trabalha para reparar a unidade, e obtém sucesso. A unidade se declara como sido construída para combate, e percebe que Torres tem capacidade de 'construtora', e pede que ela construa outras unidades, já que os construtores originais não existem mais. Janeway proíbe, mas o robô rapta Torres e a leva para sua nave. A Voyager é atacada e os robôs chantageiam Torres para que ela faça os protótipos. Torres concorda, mas no fim ela destrói o protótipo e é resgatada por Janeway.

Data Estelar: 49337.4 A USS Voyager tem sido constantemente atacada pelos kazons. E já encontra-se bastante debilitada. A tripulação pressiona Janeway para que sejam feitas alianças com os kazons, antes que a nave seja destruída. Janeway cede e tentar estabelecer relações com vários clãs, mas tudo dá errado. Por fim Neelix consegue estabelecer relações com a civilização que escravizava os kazons. Janeway propõe-lhes uma aliança, mas eles contrapropõe um pacto de paz para todo o setor. Janeway concorda e eles preparam uma reunião, mas tudo não passava de uma armação para matar todos os majes kazons, de uma vez só. Janeway percebe a tempo e salva a todos.

Data Estelar: 49373.4 Paris, Kim e Torres estão, no holodeck, testando um novo modelo de nave que poderia entrar em transdobra e viajar instantaneamente para qualquer lugar do universo. Eles estão enfrentando problemas em manter a integridade estrutural da nave auxiliar. Até que Neelix dá uma dica que os faz ver um detalhe que os estava escapando. Eles testam e tudo funciona perfeitamente. Paris faz o primeiro vôo acima do limiar de dobra, mas quando volta começa a sofrer estranhas alterações genéticas. O Doutor descobre que ele na realidade está evoluindo para uma nova espécie. Ele rapta Janeway e foge para um planeta, onde ambos transformados em uma espécie de lagartos descansam à beira de um lago, enquanto seus filhotes brincam na água. Os dois são capturados e o Doutor restaura seus genomas originais.

Data Estelar: Desconhecida Um técnico desaparece, e após algumas buscas, é encontrado dentro de um conduíte, calcinado. O Doutor conclui que ele foi assassinado e o culpado, através do DNA, é rapidamente identificado e detido. Lon Suder diz a Tuvok que o matou sem motivo, e que na verdade ele sente vontade de matar, simplesmente. Tuvok com o intuito de entender como funciona a mente do assassino faz uma fusão mental. Mas algo dá errado e, enquanto Lon Suder consegue se controlar melhor, Tuvok começa a ter ímpetos de matar. Acabando na enfermaria o Doutor começa a administrar um tratamento, que poderá ou não dar resultados. Mas Tuvok foge da enfermaria à noite e tenta matar o criminoso. Com muito custo ele consegue se controlar no último instante. O Doutor diz que isto comprava a eficiência do tratamento.

Data Estelar: 49447.0 Um míssil inteligente de origem cardassiana é encontrado no Quadrante Delta. Torres esclarece que o míssil foi enviado por ela, e devido ao Guardião, ele também foi transportado da mesma maneira que a Voyager e a nave maqui. Mas o míssil tem muitos armamentos e um sistema de inteligência artificial que o torna praticamente invulnerável. Somente Torres, por ser a sua programadora está em condições de evitar que o míssil atinja um planeta de uma civilização pacífica e inocente.

Data Estelar: 49301.2 Ao encontrarem um estranho cometa resolvem trazer um fragmento de seu núcleo para estudos, mas para surpresa de B'Ellana, aparece um ser que se identifica como "Q". Um outro "Q". Ele foi aprisionado no cometa a 300 anos por tentar acabar com sua vida. O conhecido "Q" aparece e tenta levar o fugitivo de volta, mas este pede asilo político à Janeway. Os "Q's" concordam em deixarem que Kathryn julgue em uma audiência decisória. Tuvok é convidado para ser o defensor do querelante. Por fim após várias reviravoltas, uma inédita visita ao "Continum Q", e a presença do Comandante Riker, Janeway decide ceder ao pedido de asilo. O "Q" é transformado em mortal e em seguida comete suicídio.

Data Estelar: 49504.3 A Voyager capta um chamado de emergência de uma nave vidiiana, onde uma mulher está doente à bordo. O Doutor inicia um tratamento e, para evitar a deterioração dos padrões sinápticos da paciente, ele a transfere para o computador e cria uma imagem holográfica do corpo são, permitindo que ela tenha uma experiência de se ver como teria sido se nunca tivesse contraído a fagia. Ela e o Doutor acabam se apaixonando. Denara prefere morrer a voltar a habitar o corpo doente. Mas o Doutor a convence que o amor que eles sentem é forte o suficiente para que a vida seja boa, qualquer que seja a dificuldade pela qual passem.

Data Estelar: 49485.2 Devido aos desentendimentos anteriores entre Tom Paris e seus superiores, ele pede baixa da Voyager e se alista num cargueiro talaxiano. Logo em seguida ele é raptado pelos kazons. Neelix inicia um programa jornalístico muito bom e logo adentra profundamente numa investigação sobre o rapto de Paris. Tudo era um blefe para que o verdadeiro traidor à bordo da Voyager fosse revelado. Mas o Ten Jonas acaba morrendo durante uma luta com Neelix na engenharia. Faltam apenas poucas semanas para o parto de Seska.

Data Estelar: 49548.7 Ao tentarem evitar naves dos vidiians, a USS Voyager acaba por penetrar em um fluxo de plasma que duplica toda a matéria, ou seja, a própria Voyager e sua tripulação, com exceção da anti-matéria. Em uma nave, para evitar a perda de anti-matéria, eles começam a emitir pulsos de prótons. Mas, na outra, eles começam a ser despedaçados pelos pulsos de prótons. Janeway descobre que houve uma duplicação e consegue estabelecer uma ligação entre as naves. Eles conseguem inclusive atravessar de uma para a outra. A nave que permaneceu intacta é abordada por uma nave vidiiana e a tripulação começa a ser assassinada. Janeway, da nave invadida, envia duas pessoas que morreram na nave danificada, mas que estavam vivas na nave invadida. E, em seguida, destrói a Voyager e a nave vidiiana juntas. A nave danificada é consertada e segue viagem.

Data Estelar: 49578.2 A nave auxiliar de Tuvok cai numa lua quando buscavam minério para os reparos da Voyager, matando o piloto. Tuvok descobre que existem 3 crianças na lua que foram deixadas lá para serem mortas por uma criatura mística. Não há indícios da existência de tal criatura, mas ao amanhecer duas crianças tinham desaparecido e suas roupas foram encontradas em uma caverna próxima. Por fim Tuvok entende que o processo de envelhecimento na espécie das crianças ocorre ao contrário, e a velhice pra eles é como a nossa infância. A lua é o local sagrado em que seus corpos são sepultados.

Data Estelar: Desconhecida Kim identifica um planeta orbitado por satélites artificiais desligados a muito tempo. Ao se aproximarem uma mensagem os alerta de que existe vida no subterrâneo do planeta, mas eles vivem em extase, e mantém as funções cerebrais através de realidade virtual. Mas com o passar do tempo um programa surgiu baseado no medo dos habitantes e assumiu o controle de suas vidas. Jeaneway inicia um duelo mental com o programa até enganá-lo e fazê-lo libertar as suas vítimas cativas.

Data Estelar: 49655.2 Um acidente de transporte ocorre com Tuvok e Neelix, logo após eles coletarem uma estranha forma de orquídea. Ao serem transportados, a orquídea, Tuvok e Neelix são fundidos em uma única pessoa. O ser resultante passa a si chamar de Tuvix. E por semanas ele vive entre a tripulação, conformados que o problema era irreversível. Mas o Doutor descobre um método para separá-los, e Janeway força o relutante Tuvix a ser separado em seus seres componentes.

Data Estelar: 49690.1 Janeway e Chakotay foram picados por um inseto ao explorarem um novo planeta. O inseto é portador de um vírus cuja cura o Doutor não consegue descobrir. Mas se eles permanecerem no planeta, a doença não se manifesta. Desta forma eles decidem ficar vivendo no planeta enquanto a Voyager retoma o caminho do Quadrante Alfa. Mas a tripulação tem problemas em aceitar e pedem ao novo Capitão Tuvok que entre em contato com os vidiianos, para saber se eles conhecem a cura. Denara, que é apaixonada pelo Doutor envia a vacina à Voyager durante uma batalha na qual os vidiianos tentam tomar a nave.

Data Estelar: Desconhecida Seska envia um aviso à Voyager: o seu filho e de Chakotay nasceu, mas eles estão correndo perigo de vida, porque o maje dos kazons se sente traído. Janeway elabora uma estratégia para verificar a veracidade de Seska, mas obviamente eles caem numa armadilha muito bem elaborada. Janeway fica impedida de auto-destruir a Voyager, e os kazons tomam a nave e os abandona num planeta de características pliocênicas. Mas o Doutor e Lon Suder permanecem à bordo em segredo.