Uma adaptação animada do drama de rádio "Nascimento de Mewtwo", que mais tarde foi anexado ao início do primeiro filme para o lançamento do vídeo japonês. Uma pequena versão de 3 minutos fortemente editada foi lançada nos DVDs da versão dos EUA, enquanto a versão completa sem cortes foi disponibilizada no DVD O Retorno de Mewtwo.

Uma série de curtas temáticos de inverno e natal. Os primeiros dois segmentos são Noite de Natal e Jogos Kanga.

Ash, Misty e Tracey decidem trazer todos os seus Pokémon e partir para algum lugar. Enquanto dormia, Togepi caiu de uma colina íngreme e desapareceu em um buraco. Pikachu, Bulbasaur, Squirtle, Marill, Venonat e Psyduck seguem Togepi. Eles acabam em uma árvore gigante onde Pikachu parece ter vivido antes.

Um pequeno especial baseado na vida do Pokémon Slowking.

Ash, Misty e Brock continuam explorando a região de Johto e precisam resgatar Pikachu depois que Jessie e James da Equipe Rocket o sequestram. A busca os leva ao platô escondido onde Mewtwo estabeleceu um refúgio para os Pokémon clonado do filme anterior. O malvado Giovanni está conspirando para recapturar Mewtwo e renovar seus esforços para criar um exército de Pokémon com bioengenharia. Ajudado pelo relutante Meowth, Ash e seus amigos derrotam Giovanni.

Um especial feito para a televisão que apresentou o lendário Raikou, bem como novos treinadores. Tornaram-se os três primeiros episódios de Pokémon Chronicles. Isso foi baseado no lançamento de Pokémon Crystal e é chamado assim no título japonês.

Nossos heróis avistam um bando confuso de Pokémon e percebem que algo não está certo, especialmente quando uma aurora incomum aparece no céu e suas Pokébolas e PokéNav param de funcionar! É quando eles avistam Solana, a Pokémon Ranger, que ajuda a colocar o Pokémon na direção certa. Ela explica que os Rangers detectaram uma atividade geomagnética estranha, e só então, o grupo vê um Deoxys no céu! Poderia ser a fonte do distúrbio?

Ash é pessoalmente convidado ao laboratório do Dr. Yung para testar seu novo sistema de batalha. Ao chegar lá ele se encontra com Misty e o Professor Carvalho que também foram convidados. Dr. Yung aparece e desafia Misty e Ash para uma batalha. Ele derrota Misty facilmente, mas sua luta com Ash é interrompida por uma figura encapuzada chamada Mentor da Miragem. Ele vira os experimentos do Dr. Yung contra ele e os captura junto com Professor Carvalho! Enquanto Brock pede ajuda, Ash e Misty entram no castelo para resgatar o Professor enquanto May e Max esperam do lado de fora. No entanto, o Mentor da Miragem parece incrivelmente familiar, ele está possivelmente escondendo algo?

Um menino acorda e descobre que foi transformado em um Squirtle e agora pode entender a linguagem Pokémon. Ele descobre que desastres têm acontecido recentemente e equipes de resgate foram formadas. Ele se junta a seus amigos Charmander e Chikorita no Team Go-Getters. Eles recebem uma missão em que devem ir à Caverna Sinistra para encontrar o irmão mais velho de um Pichu. No entanto, eles têm rivais na missão - Team Meanie, um time de Pokémon Ekans, Medicham e Gengar. Eles serão capazes de resgatar Pikachu e derrotar o Time Meanies?

Na região de Oblivia, um Pokémon Ranger chamado Natsuya, recebe a missão de dirigir-se ao arquipélago para impedir uma equipe do mal. Os delitos de Pokémon Pinchers de roubar e vender Pokémon a cargo do Professor Hastings. Durante sua missão, ele conhece Ukulele Pichu e o captura.

Depois de concluir sua jornada com Ash e Brock, Dawn retorna para casa e tem que decidir qual de seus Pokémon irá levar com ela em sua jornada para se tornar uma Coordenadora Superior.

Após sua jornada com Ash e Dawn, Brock voltou para casa em Pewter City para cuidar de seus irmãos, bem como estudar para conseguir entrar em uma escola de treinamento para Doutores Pokémon.

Este curta mostra Pikachu e cia. ajudando Meloetta a encontrar algumas frutas especiais que ajudarão ela a se apresentar em um próximo show. Durante suas viagens, eles encontram alguns Pokémon que precisam de ajuda. Eles encontrarão as frutas?

Depois de terminar uma missão, Virgil tem que fazer um pouso de emergência em uma montanha perto das Colinas Pokémon. Quando lá, ele descobre sobre um Pokémon estranho que ajudou vários Pokémon na área e descobre que é o Mewtwo. No entanto, à medida que aprende mais, ele descobre que Mewtwo foi gravemente ferido durante o último encontro conhecido, então ele decide ir para a montanha para encontrá-lo e ajudá-lo ...

Cilan e Pansage estão juntos em Johto após se separarem de Ash e Iris, mas se perdem na floresta.

Iris e Axew estão passeando animadamente pelas ruas de Blackthorn City, enquanto caminham em direção ao ginásio.

O Reino Mineral de Diamante está em crise, então sua líder Diancie e seus quatro mordomos Carbink decidiram caçar o lendário Pokémon Xerneas para tentar resolver as coisas. No entanto eles encontram muitas provações pelo caminho. Este episódio leva ao filme Diancie e o Casulo da Destruição.

Depois que Baraz sai para encontrar a Garrafa da Prisão para Hoopa, Meray se lembra de como os três cresceram juntos. O jovem Baraz decide que Hoopa deve usar seus anéis para ajudar as pessoas em vez de pregar peças nelas, mas nem sempre sai como planejado. Hoopa tenta ajudar um fazendeiro desesperado pela chuva, mas em vez disso o enche de doces! Quando eles devolvem os doces ao padeiro Mira, ela os coloca para trabalhar em sua loja onde Hoopa tenta ajudar, mas acaba quebrando a preciosa estátua de Mira. As crianças fazem o possível para remontá-lo, mas o resultado final é… bastante colorido. Mira fica com raiva no início, mas depois ri de seu trabalho de reparo criativo e lhes oferece alguns donuts. Hoopa fica imediatamente encantado, e de volta ao presente, enquanto Meray e Hoopa vão para Dahara City, eles planejam comer mais donuts enquanto esperam o retorno de Baraz!

Ash viaja por uma passagem na montanha até uma cidade próxima para se encontrar com seu pai. Ao longo do caminho, ele encontra um garoto misterioso com grande interesse em Pokémon.

(Nunca foi ao ar) Ash e amigos ajudam Chōta a se livrar do Barboach e Whiscash causando tremores na Ilha Jojo, quando a Equipe Rocket tem a ideia de usar o Pokémon para si.