A organização ideológica secreta Across tem um único objetivo em mente: a dominação mundial. Para isso, o líder do Across, Lord Ilpallazzo, envia sua agente excessivamente entusiástica (embora um tanto incompetente) Excel Excel para dar início ao plano, começando com a tomada de F City, na Prefeitura F. A primeira missão de Excel é livrar o mundo dos males dos artistas de mangá e animadores, começando com o criador da série, Koshi Rikdo. Será que Excel conseguirá completar sua missão e ainda segurar um emprego de meio período sem ser morta ou causar caos por onde passa? Parece duvidoso…

Across tem um novo rival em sua busca pela dominação mundial — uma força de invasão Puchuu do planeta Marte. Enquanto a cidade sofre com uma torrencial chuva, apenas uma mulher permanece energética e tola o suficiente para enfrentar o clima e salvar o mundo da invasão marciana — Excel Excel. Armando-se com seu estoque de comida de emergência, Menchi, Excel pode ser a única capaz de resistir à maior arma dos Puchuu — sua irresistível fofura…

Após ser capturada por guerrilheiros depois de acabar acidentalmente em uma zona de guerra, Excel se encontra presa na pior tortura de todas — fazendo parte de um filme B de ação! Enquanto isso, Ilpallazzo envia a nova agente da Across, Hyatt, para procurar a Excel desaparecida, mas considerando sua tendência a desmaiar a cada poucos minutos, a busca pode demorar mais do que o esperado…

Quando Ilpallazzo decide se divertir com um jogo de namoro portátil, ele não percebe que suas escolhas no jogo estão afetando as tentativas reais de Watanabe de passar um tempo com sua bela (se um pouco doente) nova vizinha Hyatt! Mas à medida que o jogo vai ficando cada vez mais difícil e louco, será que Ilpallazzo e Watanabe conseguirão alcançar um "placar" vencedor, ou tudo terminará em um catastrófico "game over"?

Para descobrir o quão corruptos são os oficiais da Cidade F, Excel e Hyatt são enviadas para se infiltrar na Prefeitura, onde logo se encontram envolvidas em um mar de enganações, trapaças e acontecimentos completamente loucos! Mas, com a ajuda de algumas dicas no estilo Resident Evil, rabiscadas na parede do banheiro, a dupla pode até conseguir desvendar os eventos que estão acontecendo na Prefeitura, sem falar em adicionar seu próprio toque de caos à situação...

Quando Ilpalazzo envia Excel e Hyatt em uma missão para reunir mais recursos para Across, a dupla se encontra viajando para as montanhas. No entanto, seja garimpando ouro ou caçando carne, encontrar recursos no meio de um cenário de drama de sobrevivência promete ser uma tarefa longe de ser fácil para nossas intrépidas heroínas! E em outro lugar, Watanabe, Iwata e Sumiyoshi enfrentam seus próprios desafios enquanto participam de um estranho seminário de treinamento e se encontram com uma nova colega — a bela e perigosa Misaki Matsuya.

Quando Kabapu envia Watanabe e seus colegas para investigar os esgotos ao redor da base da Across, Ilpalazzo envia Excel e Hyatt para lidar com os intrusos. No entanto, mesmo enquanto a dupla se familiariza com o sistema de segurança da Across, elas descobrem um tipo de intruso muito mais sinistro espreitando nos esgotos — um exército de Puchuus liderado pela nefasta Rainha Puchuu! Será que Excel e os outros conseguirão enfrentar essa força irresistivelmente fofa do mal?