Sam e Clover seguem as irritantes charadas e conseguem salvar Alex e finalmente prendem Lumière. Em outro momento, Sam recebe um convite de um admirador secreto para um almoço, sem saber que este admirador secreto na verdade é Arnold.

Um arqueólogo finge que desapareceu, e em seguida ele planeja usar magia antiga para dar vida eterna e poder a ele mesmo. As espiãs, com a ajuda do assistente do arqueólogo, deve impedi-lo. Em outro momento, Clover usa o anel de Mandy que ela deixou cair no jogo de futebol.

Percebendo que seu chefe está agindo estranhamente, as espiãs acabam descobrindo que um cientista do mal chamado Dr. V. tomou o controle sobre o cérebro de Jerry, e pretende então tomar o controle do mundo através da WOOHP.

Zanzibar está ganhando todos os jogos nos Jogos Olímpicos de Inverno, mas os atletas não estão nem treinando. As espiãs se disfarçam nos jogos e descobrem que o treinador da equipe desenvolveu um novo método indetectável de roubar no jogo, mas elas acabam em problemas.

Picos repentinos do aquecimento global e buracos na camada de ozônio começam a ocorrer ao mesmo tempo que uma loção bronzeadora nova chamada "Bloqueador Solar 10.000" vai à venda. Elas descobrem que uma ex-modelo bronzeada chamada Dia Ensolarado está aquecendo a temperatura para vender a sua loção e ficar rica!

As meninas vão em uma missão em qual têm que descobrir porque os homens estão deixando suas casas, suas esposas e até seus filhos para trás. Elas descobrem que uma nova colônia, "Possessão", está fazendo os homens ir em busca de seu "verdadeiro amor".

As espiãs investigam a banda do momento, Teensicle, quando vários membros da banda começam a desaparecer misteriosamente. Quando os membros da banda ressurgem aparentemente sãs e salvos, as espiãs detectam mudanças estranhas em suas personalidades.

Frankie Dude, um ex-surfista que bateu o dedo no cais de uma praia que virou resort, decide se vingar pela destruição das praias de surfe, criando tsunamis. Em outro momento, Sam entra em greve de fome para protestar contra a demissão da cantineira da escola, que foi substituída por uma máquina.

Procurando por presentes de Dia das Mães para suas mães, Clover, Sam e Alex encontram um panfleto sobre uma oferta especial em um spa. Mas depois que elas chegam lá percebem que suas mães não estão se comportando normalmente. Elas descobrem que o seu arqui-rival Tim Scam escapou da prisão e voltou para transformar suas mães em assassinas a sangue-frio!

Aparentemente mulheres comuns em todo o mundo estão atacando homens e as mulheres que não foram "escolhidas". Todas estas mulheres são descendentes de uma guilda antiga de mulheres guerreiras que pretendiam acabar com todos os homens e mulheres inferiores.

A nova agência de espionagem que foi fundada, está tirando todos os casos da WOOHP, a S.P.I torna-se mais popular, e faz a WOOHP cair fora do negócio. Mas Sam não abandona a profissão com facilidade, e investiga dentro da S.P.I. Mas, depois, ela foi capturada pelos agentes da S.P.I.

Sebastian escapa da prisão e ele planeja usar sua música para hipnotizar os jovens para destruir os locais favoritos das espiãs. Quando as meninas descobrem que Sebastian é o vilão por trás disso, ele hipnotiza as meninas para ajudar na destruição do Colégio Beverly Hills.

Ruivos começam a desaparecer em todo o mundo depois de visitar os novos salões de cabeleireiros. Já que Sam tem cabelos ruivos, ela deduz que ela seria a isca ideal para investigar, mas Sam e as outras espiãs não conseguem entrar no salão. Clover é chamada para fazer o tratamento, mas ela e as outras mulheres acabam sendo raptadas pelas cadeiras do salão, que formam um trem subterrâneo.

O primo de Clover é um ávido fã de "Zooney", um programa de televisão que se tornou favorito entre as crianças. Mas, enquanto isso, as crianças em toda a América tem sido dadas como desaparecidas. Jerry envia Sam, Alex e Clover a segui-las, mas antes que elas possam cumprir em sua missão, Sam e Alex precisam ajudar Clover, que está de castigo.

Enquanto Jerry pesca junto do presidente dos Estados Unidos, as espiãs bancam a babá, tomando conta da terrível Madison, de 11 anos. Isto até a garota ser sequestrada por uma aranha gigante! Em outro momento, Jerry está tentando conseguir um emprego na Casa Branca.

Animais começam a desenvolver a inteligência humana, enquanto seres humanos regridem para um estado de atraso animalesco. As espiãs refletem sobre a forma de contrariar o esquema planejado por um cientista louco que está trocando os traços de personalidade.

As espiãs vão acampar em uma remota floresta para investigar a mensagem ilegível, mas alarmante de uma equipe de reportagem da TV que desapareceu enquanto fazia relatórios de madeireiros, fazendeiros e escaladores que desapareceram na área.

Quando Alex se atrapalha em diversas missões da WOOHP, ela começa a duvidar seriamente das suas habilidades de espiã. Então, quando Jerry introduz às meninas Britney - uma espiã muito inteligente e doce, que está em treinamento, e que têm sido atribuída a ajudar as espiãs na sua próxima missão - Alex só se sente pior.

Enquanto elas estavam ansiosas para um fim de semana divertido e longe da WOOHP, a viagem de ski se transforma em um desastre quando Sam, Clover e Alex descobrem que Mandy é sua colega de quarto. Além disso, elas descobrem que um de seus antigos inimigos, escapou da prisão e está meditando vingança, que não só coloca todos em uma situação muito perigosa, mas também obriga as espiãs à capturar Dr. Gelee sem deixar qualquer pista para seus colegas que qualquer coisa desagradável está acontecendo.

Clover têm um encontro com um lindo jogador de futebol, e consegue arrastar Sam e Alex para ir junto com ela para encontrar com os irmãos do jogador de futebol. Quando as meninas vão em uma missão no Escritório Internacional de Informação, elas acabam em uma armadilha, e o vilão escapa. O elevador em qual elas estão quebra, e elas ficam presas no andar 75. Com nenhum apetrecho e quase nenhuma maneira para escapar, as meninas começam a falar de suas missões na WOOHP.

De repente, cabines para encontrar seu par perfeito começam a aparecer em Beverly Hills. Muitas das garotas ficam totalmente apaixonadas, incluindo Sam e Alex, que conseguem namorados lindíssimos. Clover suspeita que algo está errado e decide ir até o fundo dessa história, mesmo sem a ajuda de ninguém.

Quando Sam está no show de televisão "Mentes Colossais", algo misterioso acontece. Sam de repente esquece todas as respostas e ela perde. Alex e Clover suspeitam que têm algo por traz do show de televisão. Enquanto isso, Jerry tenta executar testes de inteligência na Sam, mas ela escapa.

Um fabricante de brinquedos de alta tecnologia utiliza microchips militares para fazer seus brinquedos de figura de ação mais realistas. Involuntariamente, os brinquedos começam a pensar por si mesmos e estão empenhados em dominar o mundo.

Quando uma estrela de TV famosa desaparece, as espiãs insistem que Jerry deve deixá-las partir para investigar. Uma mulher aparentemente insana, chamada Lenore confude o programa de TV com a realidade, tem planos de assassinato para Sinestro, o vilão da novela e Clover, que bancou a filha do vilão, Gwendolyn, como disfarce.

Helga Von Guggen está de volta com sua nova linha de roupas, Mystique. As roupas aparentemente sugam a vida de qualquer um que as usar, pois as roupas não podem ser tiradas.

Pessoas bem conhecidas na Inglaterra têm vindo a fazer manchetes depois de ter completamente alterando sua personalidade e interesses. As meninas investigam, porém Sam e Alex desaparecem misteriosamente. Clover chama Jerry para ajudá-la, e eles descobrem que as personalidades de cada par de pessoas afetadas têm sido trocadas.