Mesmo após 1 ano a morte de Joe Caroll, Ryan continua obcecado. E seis pessoas são mortas por seguidores de Caroll, levando o FBI a investigar.

A obsessão de Ryan fica ainda maior depois das mortes no metrô. Ao mesmo tempo, uma misteriosa ligação o coloca cara a cara com o que pode ser sua maior ameaça até hoje. Enquanto isso, revelações relacionadas à nova vida de Joe são trazidas à tona.

Ryan continua sua busca para encontrar uma correlação entre as recentes tragédias em Nova York, Emma e os atuais membros do culto de Havenport, enquanto o FBI fica cada vez mais ciente de suas atividades secretas.

Depois da última revelação chocante do caso, Ryan e Max tentam juntar as peças desse quebra-cabeça e ficar dois passos à frente do FBI. Enquanto isso, Emma fica cada vez mais próxima de Mark e Luke.

Na tentativa de conseguir novas informações, Ryan e Max capturam um suspeito. Mas o caso se complica, levando a um perigoso jogo de caça e caçador. Joe fica cada vez mais confortável em sua vizinhança e estabelece um plano próprio.

Max e Ryan pedem reforços para o FBI. Enquanto isso as relações entre Joe e sua nova família entram num novo território perigoso.

Ryan e o FBI continuam a caçada a Lily Gray e são forçados a redirecionar a busca quando uma nova ameaça entra na vida de Max. Enquanto isso, Joe, Emma e Mandy chegam ao mais novo esconderijo, mas logo percebem que as coisas não são o que parecem.

Ryan continua a procura de informações sobre a localização de Joe com a ajuda de Max, Mike e alguns contatos do FBI, enquanto isso, Joe tenta se estabilizar na nova seita junto com Emma e Mandy.

Novas informações levam Max, Ryan e Weston mais perto de descobrir o traidor dentro do FBI; Joe e Micah começam um plano para enviar mensagens para Ryan e o restante do mundo.

Na medida em que cresce a sua influência no culto Korban, Joe coloca um plano mortal em ação, usando novos seguidores para realizar o trabalho sujo. Enquanto isso, Ryan e Max elaboram um plano para contatar Joe, na esperança de rastrear seu paradeiro.

Um grande massacre, que parece ter sido desencadeado por Joe Carroll, leva Ryan e Mike a um perigoso território. Porém, quando mais detalhes são revelados, eles percebem que o ataque pode ter liderado por outra pessoa.

Joe tem como alvo o filho de um homem que está contra ele. Enquanto isso, Ryan é confrontado com a chocante reaparição de Claire, e Mandy toma uma decisão que a leva a um rosto familiar que pode desfazer tudo o que Joe tem trabalhado.

Ryan rastreia a localização do complexo Korban com esperanças de se infiltrar no culto e capturar Joe Carroll, mas tudo não acontece exatamente como o planejado.

Joe Carroll coloca seu plano final em ação, o que ameaça a vida de muitos. Enquanto isso, Ryan e Mike tentam de tudo para parar o inimigo e evitar que mais inocentes sejam atingidos.

Mark e Luke viram a mesa tanto em Ryan quando em Joe, forçando os dois inimigos mortais a se juntarem para salvar a mulher que amam.