Depois de impedir um assalto de Rupert Thorne, Batman retorna à batcaverna para saber que todos os criminosos no Asilo Arkham foram misteriosamente libertados. Batman descobre que foi um palhaço enlouquecido chamado Coringa quem os libertou, e ele planeja fazer um dirigível cheio de gás hilariante explodir sobre Gotham para que cada cidadão se transforme em lunático. Cabe ao Batman detê-lo.

Depois que um estranho abutre começa a roubar diamantes e joias, Batman decide descobrir quem está por trás disso. Acontece que o vigarista é o rude e egoísta Osward Cobblepot, também conhecido como Penguin, que vai à festa de Bruce Wayne. Alfred tenta pegar Penguin por seu mau comportamento na festa, mas infelizmente, Penguin pega Alfred. Batman deve encontrar a mansão de Penguin e salvar Alfred, bem como derrotar Penguin e devolver todas as joias e gemas que ele roubou.

Três chefes da máfia querem se vingar do Batman porque ele constantemente derruba suas operações. Eles chamam um homem muito misterioso chamado Bane para acabar com ele, de uma vez por todas. Bane pode parecer um criminoso normal, mas ele tem um segredo, um segredo tão poderoso que poderia destruir toda Gotham. Após seu primeiro encontro, Bane facilmente derrota Batman, machucando-o gravemente. Agora, Batman deve pensar em uma nova maneira de parar essa ameaça.

Depois de seguir em uma longa perseguição com sua nova inimiga, Mulher-Gato, o cinto de utilidades do Batman é roubado. Agora, com o cinto nas mãos erradas, Batman precisa descobrir como encontrar o ladrão antes que ela não use o cinto.

Um bando de morcegos leva Yin e Bennett às Indústrias Wayne, onde Bruce tem um cientista chamado Dr. Langstrom trabalhando em um projeto relacionado a morcegos. Na verdade, Langstrom realmente desenvolve um soro que pode transformá-lo no "" Homem-Morcego "", então as pessoas vão temê-lo. Homem-morcego sai de controle e voa para a cidade, alimentando-se de sangue animal.

Usando seus novos poderes de gelo, o Sr. Freeze rouba os diamantes mais raros e valiosos de Gotham. Quando ele e o Batman se cruzam pela primeira vez, ele diz ao Morcego que é a razão de ele ser um monstro criogênico. É por causa de uma perseguição muito anterior entre eles, que levou a um laboratório de criogenia. Ele não vai parar por nada para fazer de Gotham seu domínio pessoal, a menos que o Batman possa pensar em uma maneira de impedir essa ameaça.

Batman conhece Vagalume, um homem que se veste com um conjunto de mosca fortemente blindado e tem um jet pack turbo aprimorado. O Vagalume invade várias empresas de Gotham, destruindo sua tecnologia, e voa para os céus quando Batman chega. Como o Morcego descobre, ele não é um inimigo fácil de derrubar. Enquanto isso, Bruce se encontra com o prefeito Grange, que lhe diz que ele terá que dar o trabalho de caridade de seu pai para a GothCorp em vez da Wayne Enterprises devido ao seu estilo de vida.

Arthur Brown, um homem inteligente que agora se autodenomina O Mestre das Pistas, planeja vingança sobre as pessoas envolvidas no game show "" Think Thank Thunk "" por deixar seu oponente vencer anos atrás. O Batman pode detê-lo e salvar os reféns do Mestre das Pistas?

Arnold Wesker é um ventríloquo que controla Scarface, um fantoche vivo que tem uma personalidade totalmente diferente. Juntos, eles arrancam assaltos a bancos e Scarface promete que este é o último deles. Scarface, junto com dois músculos nodulares, planejam roubar uma reserva de ouro de Gotham Bank. Batman tenta parar o fantoche e seus lacaios. Enquanto isso, Alfred faz o papel de casamenteiro de Bruce.

Coringaestá fora de Arkham. Ele está perseguindo todos os responsáveis ​​por fazê-lo ser preso, transformando-os em cartas de baralho ... com o Batman sendo seu principal alvo.

Penguin tem ciúmes da riqueza de Bruce Wayne e invade a Mansão Wayne. Ele sequestra Alfred e vasculha o lugar enquanto Bruce está dando uma entrevista. Batman chega para ajudar na hora certa, apenas para ser acorrentado por Penguin também. O Batman pode encontrar uma maneira de sair dessa bagunça maluca?

O Coringa está de volta à cidade e tem uma nova invenção, o Joker putty, que pode transformar qualquer coisa em borracha ou massa. Enquanto isso, o chefe Rojas diz a seus detetives para parar o Coringa e o Batman de uma vez por todas, dizendo que os dois não têm lugar em Gotham.

Saindo depois do episódio anterior, Ethan se transforma no monstruoso Cara-de-Barro pela massa do Coringa. Depois de fazer toda a cidade temê-lo e detestá-lo como Cara-de-Barro, ele tem como alvo o homem que ele mais despreza, o chefe Rojas. Quando Batman e Yin perceberem quem ele é, eles terão que trabalhar juntos para evitar que Ethan se torne algo como o Coringa.