Carter e Teal'c vão em busca do Asgard para tentar salvar o Coronel O'Neill, mas descobrem que o inimigo do Asgard está de volta e com uma vingança. Os Senhores do Sistema procuram uma aliança com a Terra contra um inimigo comum.

Enquanto os Goa'uld ameaçam atacar a Terra, o SG-1 e o Asgard fazem uma última tentativa desesperada contra os replicadores, que capturaram Major Carter e invadiram o último posto avançado da civilização Asgard.

O SGC é colocado sob quarentena após uma infecção misteriosa deixar um oficial russo na enfermaria, mas a infecção pode não ser uma doença no final das contas.

O General O'Neill tenta se acostumar ao seu novo trabalho, mas enfrenta crises intermináveis ​​- incluindo a captura de SG-1 pelos Goa'uld.

Daniel fica preso em outro planeta, quando a chegada da equipe em um mundo alienígena acende uma violenta guerra civil.

Teal'c está preso em uma simulação de realidade virtual, no qual ele deve defender a base de um super-soldado Goa'uld.

Teal'c se torna o principal suspeito em uma investigação de assassinato, depois que ele se muda para um apartamento fora da base. Carter pensa no seu futuro com Pete.

Um homem de negócios ameaça expor os segredos da vida alienígena ao mundo.

O casamento iminente de seu filho é a menor das preocupações do Teal'c, quando o Hak'tyl planeja um levante contra os Goa'uld Moloc, levando a uma discussão entre Teal'c e Ishta.

O Stargate é roubado, levando o SG-1 a descobrir que a Trust assumiu o controle de uma nave avançada em órbita da Terra. Teal'c investiga uma série de mortes generalizadas de Jaffas.

A duplicata da Coronel Carter pede a ajuda ao SGC para derrotar o Replicator Quinto, que ela afirma ter encontrado uma maneira de combater nova arma dos Asgard.

Após a Prometheus responder um chamado de socorro de uma nave Goa'uld, toda a tripulação é transportada para a nave Goa'uld. Daniel Jackson fica preso na nave da Terra quando enquanto ela é roubada.

O SG-1 vai ao auxílio de um mundo prestes a ser invadida pelos Goa'uld, apenas para descobrir que o rei local é Harry Maybourne da Terra.

As relações entre os EUA e a Rússia ficam tensas, quando os líderes militares russos afirmam que o governo dos EUA foi comprometido pelos Goa'uld.

Jack é confrontado em sua casa por um barbeiro irado... que diz saber tudo sobre o projeto Stargate e o SG-1.

Os replicadores começam um ataque sistemático aos Goa'uld, forçando Baal a vir à Terra para obter ajuda. A Resistência Jaffa arrisca todo o seu movimento, em uma tentativa de retomar a cidade santa no domínio de Baal.

O destino da galáxia está na balança quando Sam e Jacob partem em busca da única arma capaz de parar o ataque dos Replicadores. O'Neill fica na defesa do SGC, enquanto Daniel luta contra o Replicante da Carter.

Enquanto Daniel encontra-se em uma lanchonete misteriosa em suspensão entre a morte e ascensão, o destino de Jacob toma um rumo inesperado, Jack e Sam ponderam suas vidas românticas, e Anubis desencadeia o seu plano para a destruição galáctica.

O SG-1 viaja de volta no tempo, em um ousado plano para roubar um pedaço de tecnologia antiga de Ra, o poderoso Goa'uld que governou no Egito antigo.

Com a linha do tempo alterada pelas ações do SG-1 no passado, uma versão alternativa do SG-1 deve usar a nave do tempo, recém-descoberta, para acertar as coisas.