Após a O.S.E. ser comprometida, Gregorio reativa a Academia de Espiões para treinar os filhos e outros espiões mirins para combater os planos hediondos de Cérebro Dourado.

Carmen e Juni precisam aprender a lidar com a rotina rigorosa da Academia de Espiões se não quiserem correr o risco de expulsão.

Com os planos diabólicos da S.M.A.S.H. frustrados, Cérebro Dourado encarrega o encrenqueiro DJ Otto Tune de atrair os pequenos espiões para fora da Academia.

Após descobrir os novos planos da S.M.A.S.H., dois rivais precisam deixar as diferenças de lado para evitar que a Missão Crítica caia em uma armadilha do mal.

Com a posição ameaçada por um grupo rival, os garotos da Missão Crítica precisam provar seu valor.

Os pequenos espiões descobrem que um ex-aluno de Spurious Visage é agora agente da S.M.A.S.H.

Envergonhada, Scorpion ameaça deixar a Academia de Espiões quando seu pai, o astro de TV Fegan Floop, decide trabalhar lá.

Novo Em Folha, o artista de rua preferido de P.S.I., adota o inventor como seu protegido e pede que o ajude a projetar uma nova instalação de arte industrial.

Os líderes da equipe, Carmen e Juni, terão de encarar uma prova difícil para, mais uma vez, evitar a expulsão da Academia.

Finalmente com espírito de equipe, os garotos da Missão Crítica enfrentam sua tarefa mais difícil: a destruição da base de Cérebro Dourado.