A CBI investiga o assassinato de uma mulher que foi encontrada sufocada depois de ter sido acusada de roubar milhões de dólares de seu empregador. Enquanto isso, Jane e Lisbon apenas podem assistir à investigação, pois o caso de Red John é tirado das mãos deles e dado de volta ao agente Sam Bosco.

Lisbon e sua equipe trabalham no caso do assassinato de um estagiário do senador, enquanto Jane tenta, ao mesmo tempo, descobrir que novas informações Bosco encontrou sobre o caso de Red John.

Depois de receber uma dica anônima, a equipe da CBI encontra o cadáver de um pedófilo que Lisbon prendeu há anos com Sam Bosco. Agora Lisbon vira a principal suspeita do crime.

A CBI investiga o assassinato de um poderoso advogado criminal cujos únicos clientes eram uma gangue de motociclistas famosos.

Jane e a CBI se deparam com um fantasma e uma mansão assombrada, quando investigam a morte misteriosa de um homem rico. A única testemunha do crime diz que ele foi morto por um fantasma em sua mansão.

Bosco prende Jane e o coloca na prisão por ele ter espionado a equipe da CBI enquanto eles investigavam o caso de Red John. Mesmo atrás das grades, Jane consegue ajudar Lisbon e sua equipe a resolverem o assassinato de um jovem.

Quando a CBI é chamada para investigar o sequestro de uma rica herdeira da Califórnia, a forte animosidade de Bosco contra os métodos não-convencionais de Jane ameaça a vida da vítima raptada.

Um tiroteio fatal dentro dos muros da CBI coloca Jane, Lisbon e o resto da equipe novamente na trilha de Red John.

Jane e o CBI investigam o assassinato de um rico joalheiro, que foi morto durante um evento de caridade. Entretanto, a investigação toma rumos interessantes - para pior - quando o principal suspeito é morto.

Lisbon e a CBI investigam o assassinato de um profissional de baseball que montou o seu próprio centro de esportes para descobrir talentos do baseball. Enquanto isso, Jane precisa lidar com seu passado da época em que atuava no palco.

A CBI investiga o assassinato de um casal a caminho da reunião de seus ex-colegas de escola.

Um reporter é contratado para fazer um documentário sobre a CBI.

Quando o corpo de Liselle Douglas, uma bela e jovem vendedora de automóveis, é descoberto no porta-malas de um veículo em uma revendedora de elite, Jane e o CBI são chamados para investigar.

Jane fica sozinha com Cho, que ajuda a polícia na investigação de um assassinato - a vítima era companheira de gangue em sua juventude, e também seu melhor amigo.

Jane e sua equipe são chamados para investigar o assassinato de Gabriel Barge.

Depois de ser intoxicado com uma toxina, a pesquisadora de armas nucleares Dra. Alicia Seberg pede a Jane e a CBI que encontrem o bioterrorista responsável pelo ataque.

Jane e a equipe investigam o assassinato de um tutor. Logo a investigação se transforma em uma caçada por um anel de valor incalculável roubado do British Museum. Lisbon fica preocupada quando Molly Hightower fica responsável pela CBI.

Sofrendo com amnésia após ter sobrevivido a uma tentativa de assassinato, Jane, Lisbon e o resto da equipe ajudam uma desconhecida a se lembrar do que aconteceu. Incapaz de se lembrar do nome, profissão, gostos ou da pessoa que a baleou, Jane usa todos os seus truques para tentar recuperar a sua memória. A equipe descobre que ela é Camille Dillon, uma jornalista baleada e abandonada para morrer quando descobriu a verdade sobre um caso que estava investigando.

Jane sai em missão para provar que o promotor Marc Odenthal é culpado de contratar o assassino de aluguel Cale Sweeney para matar sua rival, Kelly Flowers.

Jane e a equipe do CBI visitam o Visualize Self-Realization Center, um tipo de culto religioso para ricos, instituição que parece ter relação com a morte de um homem poderoso da mídia.

A equipe do CBI investigará a morte de um gênio da matemática assassinado por um palhaço.

Quando a equipe investiga a morte do filantropo Hector Brava, Patrick se junta novamente à paranormal Kristina Frye.

Quando o CBI conduz uma investigação de assassinato cometido por alguém que copia Red John, Jane convence Hightower a não deixar Kristina Fryer ajudar no caso. Mas então ela tenta contatar o verdadeiro Red John pela TV.