Koyomi Araragi, um estudante de ensino médio do terceiro ano, recentemente sobreviveu a um ataque de vampiro e se vê cercado de todos os tipos de aparições: deuses, fantasmas, mitos e espíritos.

Sobreviver a um ataque de vampiro, conhecer várias garotas atormentadas por entidades sobrenaturais e apenas tentar sobreviver à vida são algumas das coisas com as quais a estudante do ensino médio Koyomi Araragi teve que lidar recentemente. Além de tudo isso, ele acorda uma manhã e se vê sequestrado e amarrado por sua namorada Hitagi Senjougahara. Tendo colidido com Deishuu Kaiki, um vigarista que enganou a mãe de Senjougahara, ela decidiu aprisionar Araragi para mantê-lo a salvo do vigarista. Mas quando Araragi recebe uma mensagem frenética de sua irmã Karen, ele descobre que a fraude está voltada para ela. Junto com os problemas de Karen, sua outra irmã, Tsukihi, está tendo problemas por conta própria. E quando duas mulheres misteriosas que parecem saber mais do que deveriam sobre Araragi e seu grupo especial de amigos entram em suas vidas, nem ele pode antecipar seus verdadeiros objetivos, nem as verdades catastróficas que serão reveladas em breve.

Tsubasa e Hitagi descobrem que Koyomi desapareceu e os pediu em uma mensagem de texto para não procurá-lo. No entanto, em sua ausência, novas aparições perigosas começam a aparecer e visam Tsubasa e Nadeko, que são deixados para tentar lidar com eles por conta própria. Enquanto isso, Koyomi Shinobu e Mayoi estão lidando com problemas sérios.

Durante o mês de outubro de seu terceiro ano no ensino médio, Koyomi Araragi é apresentado a um estudante transferido chamado Ougi Oshino por seu estudante de graduação Kanbaru Suruga. Ougi diz a Koyomi que ela tem algo que deseja consultar com ele. Quando ela desenha o mapa da Naoestu High School, ela encontra algo peculiar lá. Essa descoberta revela uma história que não era para ser contada, e isso torna a vida de Koyomi no ensino médio totalmente diferente. Esta é a história que traz à luz "o que" faz Koyomi Araragi. Esta é a história que revela o "começo" de tudo.