Um verão se passou desde que “A” foi preso, mas Aria, Emily, Hanna e Spencer voltam a ficar na defensiva após um chocante acontecimento que abala Rosewood.

“A” deixa um terrível aviso de que é ele quem está dando as cartas, e Aria, Emily, Hanna e Spencer tentam bolar um plano para lidar com essa ameaça.

A mãe de Spencer começa a atender Garrett e Spencer acaba descobrindo um segredo da família Hastings. Emily também recebe notícias surpreendentes.

As visitas a Mona causam conflito entre Hanna e Caleb. Enquanto isso, Aria reluta em dizer à sua mãe que seu pai está namorando de novo.

Garrett consegue uma licença para sair da cadeia e visitar sua mãe exatamente no dia do aniversário da Jenna, e as meninas desconfiam.

Hanna recebe uma importante dica de Garrett e tenta descobrir quem o está ajudando, e Spencer tenta entender o significado da pista.

Novas provas sobre o assassinato de Alison são descobertas. Hanna recebe uma visita do Detetive Wilden e teme que “A” esteja tentando incriminá-la. Aria questiona Mona.

Emily luta para lidar com a morte de Maya, com o fato de ter sido drogada “naquela noite” e com o peso que isso teve sobre Paige.

Spencer e Aria acabam indo à festa dos irmãos Kahn para tentar salvar a carreira acadêmica de Spencer. Hanna recebe um texto de “A” sobre Caleb.

As garotas tentam montar o quebra-cabeça após descobrirem que o chalé de Noel teve algo a ver com “aquela noite” e talvez com o desaparecimento de Maya.

Emily está finalmente se dando bem com Paige e não está pronta para ouvir Spencer contar os detalhes sórdidos da história entre Paige e Alison.

Com o julgamento de Garrett, a atenção da mídia se volta para Rosewood. Emily continua distante de suas amigas por causa de Paige e não sabe a quem pedir ajuda.

As meninas estão loucas para se divertir no Halloween, mas o trem fantasma de Rosewood lhes reserva muito mais do que travessuras ou gostosuras.

Mona recebe alta da clínica psiquiátrica e volta para a escola, deixando as meninas pasmas.

Após os terríveis acontecimentos na maratona da escola, Aria, Emily e Spencer têm certeza absoluta de que Mona está aprontando de novo.

Uma gripe deixa Aria de cama, então Hanna e Emily investigam uma nova pista sozinhas. Meredith toma conta de Aria, mas com possíveis segundas intenções.

Aria sabe que devia contar a Ezra sobre seu filho, mas ela não está pronta para sofrer as consequências. Hanna está determinada a descobrir o que Caleb está escondendo.

Os restos mortais de Ali estão com sua família, mas após tudo que aconteceu desde seu desaparecimento, as garotas não sabem se deveriam ir a mais um funeral.

Spencer continua caindo ao fundo do poço ao descontar sua raiva em Mona. Hanna planeja reunir Caleb e seu pai, mas será que o tiro vai sair pela culatra?

Abaladas com os recentes acontecimentos e em posse de novas informações sobre o Detetive Wilden, as meninas buscam obter mais detalhes sobre o passado do policial.

Spencer está pronta para falar, mas Emily não está preparada para ouvir o que ela tem a dizer. Ashley se envolve em um atropelamento e Hanna ajuda sua mãe.

Spencer desaparece e as garotas saem desesperadas em busca de respostas, temendo que tenha acontecido o pior. Porém, é possível que ela tenha sumido por vontade própria.

Cada uma das garotas é colocada em uma situação difícil e muita coisa está em jogo. Será que elas vão conseguir sair dessa ou será que estão exatamente onde “A” queria?

No final desta temporada, novas revelações chocantes vêm à tona e as garotas não têm tempo para se preocupar com a frágil saúde de Spencer.