Dois irmãos são admitidos no Primeiro Colégio da Universidade Federal de Magia. Enquanto a menina é colocada na Turma 1, o menino é colocado na Turma 2. A discriminação é algo presente e começa a incomodá-los logo no primeiro dia de aula... Afinal, o que separa uma turma da outra?

Miyuki e Tatsuya são convidados para assumirem cargos importantes no Comitê Disciplinar e no Conselho Estudantil, mas tem gente contra isso, já que Tatsuya é da Segunda Turma, e um Weed não deveria assumir posições importantes no Colégio.

Os estudantes do Primeiro Colégio começam a perceber como Tatsuya é poderoso. Enquanto isso, Tatsuya faz sua ronda como tarefa do Comitê Disciplinar e acaba precisando intervir em uma briga entre dois famosos duelistas de kendo.

Tatsuya precisa depôr sobre o ocorrido após a luta de kendo. Enquanto caminha rumo ao Ginásio para impedir outra briga, Tatsuya é atacado, o que o leva a pensar a respeito da organização anti-magia Blanche.

Está para acontecer um fórum aberto com relação a discriminação entre a Primeira e a Segunda Turma. Na discussão, participará a presidente do Conselho Estudantil, conhecida por não perder debates fundamentados logicamente. Uma surpresa desagradável acontece ao final do encontro e Shiba fica impressionado.

Mibu é encontrada junto com os outros estudantes tentando obter acesso ao material confidencial do colégio. Agora, eles estão atrás da Blanche.

A perseguição contra a Blanche continua, mas quais serão as medidas adotadas pelos alunos do Primeiro Colégio? Eles se organizam para fazer a última investida e coagir o grupo de terroristas.

Tatsuya é um dos nomes que surge para preencher a equipe de engenharia para a Competição dos Nove Colégios. No entanto, por ser aluno do primeiro ano e pertencer à Segunda Turma, ele precisará demonstrar que sabe fazer ajustes em um equipamento DAI.

Tatsuya apresenta seu novo dispositivo na FTL e é um sucesso absoluto. Na escola, eles se preparam para ir ao local de encontro da Competição dos Nove Colégios. No caminho, algo acontece.

Os preparativos para a competição estão quase prontos. Enquanto isso, Tatsuya e Miyuki se instalam no hotel, e Mikihiko descobre uma presença estranha por perto.

Os alunos dos Nove Colégios estão disputando em diversas modalidades e almejando o título principal, de qual Colégio é melhor. Enquanto eles avançam pelas qualificatórias, os estrategistas do Primeiro Colégio alertam: eles precisam vencer quatro das seis modalidades para terem chances.

Durante o Battle Board Feminino, Watanabe Mari sofre um acidente e é levada para o Hospital. Tatsuya ajuda ela a se recuperar com sua magia, mas mesmo assim, ela ainda teve que se retirar do Mirage Bat. Tatsuya suspeita que aquele acidente não foi acidental!

Continua a competição e a fama de Tatsuya só cresce com engenheiro. As qualificatórias estão acabando.

Depois de um ocorrido, Tatsuya recebe um convite. Enquanto isso, alguém está perto de descobrir a identidade de Taurus Silver. A competição continua.

As partidas do Monolith Code estão acontecendo e o duelo entre Ichijo e Tatsuya se aproxima.

A final do Monolith Code começa. Qual a estratégia que Tatsuya vai montar para garantir a vitória para o Primeiro Colégio? Será que ele consegue derrotar George e Ichijo?

Um outro ataque durante a Competição dos Nove Colégios e, quem está por trás destes ataques, entra em desespero para conseguir impedir o Primeiro Colégio de vencer.

A competição chega ao fim e Tatsuya está cada vez mais perto de acertar as contas com quem tentou prejudicar sua querida irmã.

A Competição de Teses se aproxima e Tatsuya foi convidado a entrar para a equipe que representará o Primeiro Colégio. Enquanto isso, um conflito e uma caçada começa pelas Relíquias capazes de armazenar Sequências Mágicas.

A revelação de notas tecnologias durante a Competição de Teses acabou despertando o interesse de organizações obscuras. Os alunos do Primeiro Colégio estão correndo risco de vida.

A organização para a Competição de Teses continua, assim como as tentativas para frustrar o esforço de Tatsuya.

Tatsuya acabou descobrindo quem era o espião no Primeiro Colégio, mas reviravoltas acontecem e todos correm perigo.

Começa a Competição de Teses. Tatsuya encontra com Cardinal George e um embate no campo teórico está prestes a ter início.

Os ataques começam e Tatsuya precisa trabalhar em grupo com os outros alunos do Primeiro Colégio para realizar a proteção e evacuação dos civis.

Depois de acontecer alguns problemas com a passagem subterrânea, o pessoal da Competição de Teses precisará encontrar cheio de fazer a evacuação. Enquanto isso, Tatsuya e o exército descobrem quem são os inimigos.

A disputa final entre a defesa de Yokohama e a Grande Aliança Asiática chega ao fim.