A bordo do Módulo 77 do JIOR Sphere 01, Haruto Tokishima perde um concurso de comida para Shōko Sashinami pelo uso de seus terrenos escolares enquanto, sem o conhecimento deles, cinco agentes Dorssian disfarçados se infiltram na Sakimori High School. Algum tempo depois, como os agentes exploram a escola para um destino, um deles tem uma breve briga com Haruto sobre suas diferentes visões de mundo. Depois, os agentes Dorssian se infiltram e matam os cientistas em um laboratório secreto sob a escola, embora um cientista ferido ejete seu alvo principal, um mecha gigante chamado Valvrave 01 para a superfície da escola.

Kyūma Inuzuka, Aina Sakurai e Saki Rukino chegam ao local da Valvrave para encontrar Haruto e L-elf inconscientes. À medida que os outros agentes Dorssian chegam, L-elf aparentemente trai seus companheiros e ajuda os alunos a fugir. Depois, quando as forças Dorssianas ocupam o Módulo 77, Haruto convence seus amigos de que ele de alguma forma possuía o corpo de L-elfo e depois retoma a Valvrave, enquanto ele também consegue retornar ao seu próprio corpo com a ajuda de Saki. À medida que a Valvrave ativa e ataca a nave Dorssiana próxima, ela é lançada para fora do Módulo no espaço. A-drei e Q-vier então usam Dorssia Ideal Mechs para atacar o Valvrave 01 enquanto acreditam que L-elf os traiu.

As forças ARUS prendem L-elf enquanto ele retransmite uma estranha sequência de palavras para Haruto. Enquanto as forças ARUS junto com o senador Figaro fornecem alívio aos alunos da Academia Sakimori, Haruto e seus amigos tentam e falham em deduzir a natureza de suas novas habilidades. Depois, Figaro manda uma mensagem para conhecer Haruto e o exorta a se tornar um símbolo de esperança na guerra contra Dorssia. Enquanto isso, enquanto L-elf escapa de seu cativeiro, Cain despacha A-drei, X-eins, H-neun e Q-vier em outra tentativa de recapturar o Módulo 77.

O presidente Jeffrey Anderson e o senado da ARUS votam na obtenção da arma JIOR Valvrave para ajudar em sua campanha contra Dorssia. Enquanto isso, depois de rejeitar o contrato de L-elf, Haruto não consegue impedir Figaro de experimentar a Unidade 01 - resultando na morte de um piloto ARUS. A frota Dorssian então faz um ataque inicial contra o Módulo 77 que leva Figaro a priorizar sua segurança sobre os alunos Sakimori em uma transmissão interceptada por Shōko e Akira Renbōkoji. Shōko então usa meios drásticos para informar o Conselho Estudantil da traição de Figaro e enquanto Takahi Ninomiya distrai os representantes da ARUS, Shōko, Kyūma e Yūsuke Otamaya resgatam Haruto. Como Figaro tenta sair, Haruto então aparece e revela suas verdadeiras intenções para o corpo discente descrente. Tendo perdido a paciência, Figaro começa a atirar nos alunos até que Haruto o impede com a Unidade 01.