No mundo moderno, uma youkai emerge da Árvore Sagrada no Templo Higurashi, acompanhado de Setsuna, a gêmea de Towa, e da caçadora de recompensas Moroha. Juntas, as três sofrem para enfrentar a youkai, fortalecida com o poder de duas Pérolas do Arco-Íris, mas a visão de Setsuna em perigo desperta os poderes latentes de Towa.