Uma Gotham mergulhada no caos atrai antigos vilões. Gordon e Bruce lutam para manter a cidade segura. Selina enfrenta a incerteza do futuro.

Bruce vai atrás de uma suposta bruxa. Gordon e Bullock seguem uma pista até uma fábrica cheia de crianças desaparecidas. Nygma encara seus demônios.

Os refugiados estavam em um local seguro de Gotham, até Pinguim aparecer para buscar seu pessoal. Selina está decidida a encontrar Jeremiah e pede ajuda a Bruce.

Após um ataque explosivo, Pinguim oferece ajuda a Gordon. Lucius e Nygma chegam a um acordo. Selina faz uma busca mais direcionada.

Numa tentativa de restaurar a ordem, Gotham sofre uma intervenção militar. A busca de Nygma por respostas o leva até Pinguim e o faz reencontrar Hugo Strange.

Numa guerra de alianças improváveis, Gordon reúne uma equipe para recuperar o controle de Gotham. Uma vilã nova e astuta deixa Pinguim e Selina em alerta.

Gordon corre contra o tempo para encontrar o criminoso que ameaça a reunificação de Gotham. Um conhecido vilão retorna com a ajuda do Chapeleiro Maluco.

Um vilão que muda de forma e tem como alvo os policiais de Gotham conecta Bullock a fantasmas de seu passado. Bruce e Alfred vasculham os esgotos da cidade.

Ferido, Gordon cai em sono profundo e tem um sonho febril onde é julgado por uma série de erros. Ivy está de volta e tem em Bruce o seu alvo.

Bruce e Gordon ficam cara a cara com Eduardo, que passou por uma grande transformação. Prestes a dar à luz, Barbara pede ajuda a Lee.

Bane e Nyssa apertam o cerco, e Gordon recorre a velhos inimigos para tentar salvar a cidade. Uma decisão importante muda o destino de Bruce.

Dez anos após ter deixado Gotham, Bruce retorna para a inauguração da Torre Wayne e encontra uma cidade sombria que precisa de um cavaleiro.