No Ato 3, Nagisa e Iczer-One lutam contra o mecha de Iczer-Two, Iczer-Sigma. Mais tarde, o líder do Cthuwulf, Big Gold, ordena a captura e conversão de Nagisa na parceira de Iczer-Two. Iczer-One deve tentar salvar Nagisa e derrotar sua irmã e Big Gold em uma batalha final pela sobrevivência da humanidade!