No Ato 2, uma fortaleza de Cthuwulf chega à Terra. Nagisa faz amizade com uma jovem enquanto Iczer-One investiga a fortaleza alienígena. Iczer-One fica preso no subespaço e Nagisa é forçada a proteger a jovem dos monstros parasitas. Iczer-One escapa apenas para enfrentar o desafio de um novo inimigo, sua "irmã" Iczer-Two!