A Oficial Sun faz uma improvável aliança para salvar John e D'Argo, enquanto Scorpius continua sua perseguição. Moya vai em busca de seu recém-nascido, uma nave de guerra agora sob o controle do Capitão Crais.

D'Argo encontra uma sacerdotisa Luxan que está à beira da morte, até que ela descobre uma maneira de reverter seu envelhecimento.

Chiana se junta a um grupo de thrillseekers imprudentes quando ela descobre que seu irmão morreu.

Um cientista alienigena usa Moya para o seu próprio proposito, enquanto a tripulação faminta, fica excessivamente desconfiada um dos outros.

Pilot e Aeryn devem reviver seus passados escuros, quando Chiana acha uma gravação onde a ex-oficial Pacificadora, ajudou a executar o primeiro piloto de Moya.

Maldus retorna para atormentar a tripulação, convencendo-os de que seus amigos estão perdidos. Um por um, o feiticeiro do mal arrasta-os para o seu reino.

Quando a saúde de Zhaan começa a falhar devido a desnutrição, a equipe espera uma ajuda em uma colônia de mineração. Aeryn e Pilot trabalham para salvar Moya dos esporos de Zhaan.

Zhaan é presa e levada a julgamento por assassinato, e Chiana e Rygel devem defendê-la. Desesperado para encontrar Talyn, Moya pretende deixá-los no planeta e continuar a sua pesquisa.

Um acidente faz com que a tripulação passe a trocar de corpo uns com os outros, enquanto Zhaan tenta evitar que uma nave alienígena dispare em Moya.

Um objeto alienígena clona Crichton, criando uma versão altamente avançada e uma versão besta não evoluida. É preciso se sacrificar para salvar a nave.

Crichton é manipulado para pedir uma princesa alienígena em casamento, a fim de evitar problemas com Scorpius.

Crichton vai as vias de fato para evitar ser morto, mas finalmente consente em se casar com a princesa Katralla e ser transformado em uma estátua viva por 80 ciclos.

O príncipe Clavor e seu associado Scaran se unem contra Crichton, decapitando sua estátua. A tripulação deve salvar John e Chiana, enquanto tentam escapar de Scorpius.

Chiana traz a bordo um parasita comedor Vorc, quando a tripulação desconfia que sua alimentação tenha sido contaminada. Crichton luta com alucinações com eles procurarando a criatura.

Crichton acorda e se vê de volta à Terra - ou alguém quer que ele acredite. Ele se recusa a cair no truque, especialmente quando seus amigos estrangeiros começam a aparecer.

Uma armadilha de distorção temporal levam Aeryn e John para a superfície de um planeta, onde vivem o resto de suas vidas - enquanto Moya permanece presa em órbita, passando apenas algumas horas. Stark retorna para a nave com notícias do filho de D'Argo.

Quando Talyn destrói uma nave Plokavian, a equipe de Moya é levada a julgamento por homicídio. Cada um recorda os acontecimentos de seu próprio ponto de vista.

O Nebari vêm procurando Chiana, já meia-purificada por seus amigos em Moya. Chiana faz uma descoberta surpreendente sobre seu irmão, e sobre seu povo.

Stark retorna com um plano para salvar o filho de D'Argo: roubar um banco de alta segurança e usar o dinheiro para comprar o lote Jothee de escravos.

Crichton e companhia formam uma equipe de mercenários para ajudá-los a roubar o depósito de sombra, enquanto Scorpius se concentra em sua presa. Zhaan faz um movimento desesperado para salvar Moya de uma infestação.

Crichton se entrega a Scorpius, de modo que seu implante cerebral possa ser removido, e a tripulação lança um ataque final sobre o deposito de sombra para resgatá-lo.

Quando Crichton vai a um médico especialista para remover o implante cerebral de Scorpius, ele assume o seu corpo, e a tripulação sofre uma perda trágica.