No Ninho do Tempo, sede da Patrulha do Tempo, o Supremo Kaioh do Tempo informa a Xeno Trunks e Xeno Pan que seu pássaro místico Toki-Toki desapareceu. Ela envia os dois para encontrá-lo, enquanto também está preocupada com um suposto "Pássaro da Catástrofe" que foi lançado. Enquanto isso, Toki-Toki apareceu na Terra na linha do tempo principal, onde Goku o encontra enquanto treina com Vegeta, Gohan, Piccolo, Kuririn e Android 17. Xeno Trunks e Xeno Pan chegam e ficam felizes em ver que Toki-Toki está seguro. , com Xeno Pan explicando que sua existência é muito importante para o funcionamento interno do multiverso. De repente, o grupo é interrompido pela chegada de todos os doze Deuses da Destruição.

Goku, Vegeta e Xeno Trunks estão lutando contra Beerus, enquanto os outros e os outros Deuses da Destruição assistem. Beerus tem a vantagem, até que sua batalha é interrompida pela chegada de Xeno Goku e Vegeta, que os avisam que eles precisam parar a luta. De repente, uma massa de raízes de árvores gigantes aparece no céu ao redor da Terra e começa a drenar a energia do planeta. Todos os outros deuses correm de volta para seus próprios universos para protegê-los, deixando Beerus, os heróis da Terra e os Patrulheiros do Tempo para trás. Eles são então confrontados por Fu, que é acompanhado por Doki-Doki. Fu confirma que este é o "Pássaro da Catástrofe" com o qual Beerus estava preocupado e que as raízes das árvores são parte da Árvore do Universo, que cresceu a partir da Semente do Universo que Hearts estava desenvolvendo.

Fu, acompanhado por uma companheira desconhecida, se encontra com um grupo de vilões - Meta Cooler, Turles, Bojack, Super Android 17 e um misterioso cientista humanóide conhecido como Dr. W - na Árvore do Universo, onde ele revela que resgatou todos os vilões dos momentos antes de suas mortes nas mãos dos Z-Fighters e os convence a ajudá-lo em troca de lugares no novo universo que ele está criando. Enquanto isso, Goku, Vegeta, Xeno Trunks e Xeno Pan estão procurando por Fu, quando são atacados por Turles e Bojack. Os dois vilões revelam que Fu foi capaz de aumentar seu poder imensamente, já que agora são fortes o suficiente para lutar a par com as formas Super Saiyajin Blue de Goku e Vegeta e têm auras semelhantes às de Cumber. Enquanto a batalha continua, Xeno Trunks vê Fu observando a luta: Goku e Vegeta tentam enfrentá-lo, mas Turles e Bojack bloqueiam seu caminho. Em outro lugar, Xeno Goku e Xeno Vegeta chegam ao Inferno e são confrontados pelo misterioso Dr. W.

Dr. W começa o que ele chama de "análise" de Xeno Goku e Xeno Vegeta atacando-os com estranhas explosões de energia teletransportadas. Ambos energizam o Super Saiyajin 3 e o envolvem em combate, mas ele é capaz de segurá-los com seus ataques estranhos e reflexos de alta velocidade. Depois de ter dificuldade em dominá-lo, eles ligam o Super Saiyajin 4 e lançam uma poderosa explosão combinada nele; no entanto, o Dr. W deliberadamente leva seus ataques de frente e emerge da fumaça com uma aura dourada brilhante idêntica à deles. Tendo completado sua análise, ele abre um portal e escapa. Enquanto isso, Fu está observando a batalha entre Goku, Vegeta, Turles e Bojack. Ele libera Doki-Doki, que gera ondas de energia escura que imobilizam Goku, Vegeta, Xeno Trunks e Xeno Pan. Toki-Toki tenta desarmar a energia escura, mas Fu o prende e o joga através de um portal, antes de chamar Doki-Doki e escapar através de um.

No Inferno, Xeno Goku e Xeno Vegeta, mesmo ambos como Super Saiyajin 4, lutam contra o renascido Janemba, que está ciente de todas as suas habilidades e táticas, o que lhe permite dominar facilmente os dois Saiyajins. Apenas quando Janemba está prestes a acabar com eles, Xeno Trunks, Xeno Pan, Goku e Vegeta chegam ao Inferno através de um buraco de minhoca, juntando-se à luta. Xeno Trunks se transforma em Super Saiyajin 3, enquanto Goku e Vegeta se transformam em Super Saiyajin Blue. Super Saiyan Blue Goku e Super Saiyan 4 Xeno Goku então se unem e começam a dominar Janemba com seus ataques simultâneos. Mas não muito tempo depois, Putine e Majin Salsa chegam ao Inferno e derrubam Janemba, enfurecendo o Dr. W por interferir na luta.

Xeno Trunks identifica os recém-chegados, Majin Salsa e Putine, como demônios e velhos inimigos da Patrulha do Tempo. No entanto, os demônios se oferecem para ajudar os heróis em seus esforços para destruir a Árvore do Universo de Fu, avisando que a Árvore continua seu trabalho de consumir inúmeros planetas em todo o multiverso. Janemba ataca todos eles novamente antes que os dois grupos cheguem a um acordo, e a batalha recomeça, com Xeno Trunks se fortalecendo para Super Saiyan God. Majin Salsa sugere que Xeno Goku e Xeno Vegeta usem uma técnica misteriosa que eles empregaram no passado, então os outros Saiyajins se fortalecem e canalizam sua energia para o par enquanto os dois demônios seguram Janemba. Ao absorver a energia dos outros, Xeno Goku e Xeno Vegeta rompem seus limites e alcançam um nível mais alto de força, conhecido como Full-Power Super Saiyan 4.

Goku, Vegeta, Xeno Goku, Xeno Vegeta, Xeno Trunks, Xeno Pan, Majin Salsa e Putine chegam na Árvore do Universo, que ainda está absorvendo energia do multiverso. Vegeta tenta destruir a Árvore com uma grande explosão de ki, mas ela absorve a energia. Fu então aparece e confronta o grupo, informando que planeja criar um novo universo usando a Árvore. Xeno Goku, Xeno Vegeta, Xeno Trunks e Xeno Pan são subitamente teletransportados pela companheira de Fu, que se revela ser Towa; ela diz a Fu que está fazendo algo por ele, e então se teletransporta junto com Majin Salsa e Putine. Vegeta se transforma em Super Saiyajin Blue e ataca Fu, mas Fu revela que agora ele tem acesso à energia de Cumber e canaliza a aura de Cumber através de seu próprio corpo, usando seus efeitos para corromper o ki de Vegeta e deixá-lo furioso. Goku tenta intervir, mas Fu corrompe seu ki também.

Towa restringiu Xeno Goku, Xeno Vegeta, Xeno Trunks e Xeno Pan em seu espaço artificial usando o ki escuro de Cumber, e continua a revelar a natureza de Fu como sua criação usando dados de lutadores e vilões anteriores de Dragon Ball. Ela explica que seu plano é fazer Fu como o novo Rei Demônio usando o ki de Mechikabura que ela armazenou em um orbe de energia escura após sua morte. Xeno Goku consegue se libertar e ataca Towa, apenas para ser bloqueado por Mira. Towa teletransporta Xeno Gohan e Xeno Goten para o espaço, ambos inconscientes, pois seu ki foi drenado antes, então teletransporta Mira e ela para fora quando o espaço quebra, puxando tudo para dentro de algo como um buraco negro. Enquanto isso, Vegetto em Super Saiyajin Blue está lutando contra Fu na frente da Árvore do Universo e aparentemente levando vantagem.

Fu fica horrorizado com a morte da Árvore do Universo, até que Towa e Mira chegam para ajudá-lo. Towa infunde a energia de Mechikabura em Fu, aumentando drasticamente seu poder e fazendo com que ele se transforme no novo Rei Demônio. No entanto, Fu não expressa interesse nisso e começa a usar seus novos poderes para restaurar a Árvore. Vegetto tenta detê-lo e sua luta recomeça, mas Towa e Mira intervêm para ajudar Fu e ganhar tempo para ele atacando Vegetto.

Xeno Vegetto começa a lutar contra Fu; os dois parecem estar empatados, até que Fu usa sua magia negra para mudar a área ao redor deles. Ele manifesta uma grande aura de combate para eles lutarem e se prepara para enfrentar os dois Vegettos na batalha, até que os três sejam interrompidos pela chegada repentina do Broly alternativo em sua forma Lendária de Super Saiyajin.

Xeno Vegetto supera a onda de energia antes que ela se dissipe, deixando a área ao redor da Árvore ilesa; ele retorna para encontrar Fu segurando a forma miniaturizada do novo universo criado pela Árvore. No entanto, Fu está desapontado com sua criação, pois o novo universo é falho porque Fu teve que usar seu próprio poder demoníaco para reabastecer a Árvore em vez da energia pura de um universo normal.