A cena inicial são os 3 cybercops destransformados mais Tomoko tocando numa casa de shows. Até que surge um chamado para prender criminosos. As armaduras e armas são apresentadas. Depois surge a Destrap (a organização inimiga). Os Cybercops não conseguem dar conta, mas surge um policial com amnésia chamado Shinya Takeda. Ele meio que sem saber porque, entra na cabine de transformação e se torna Júpiter, o cybercop mais poderoso. A cyber Força dele é apresentada e o inimigo derrotado.

Takeda entra no ZAC (polícia responsável pelos Cybercops) e começa a treinar. Nos restos de uma cidade aparentemente do futuro, um inimigo surge. Os cybercops detém ele.

Um tanque supostamente mais poderoso que a equipe do ZAC é construído para substituir os Cybercops. Mas mais tarde o tanque sai do controle e começa a atacar todo mundo

Uma super programadora que só acredita nos computadores e não nos humanos é visada pela Destrap já que ela poderia fazer vírus e enlouquecer os computadores de Tóquio. Obviamente ela é detida.

Um príncipe mimado de um país não revelado chega ao Japão. Pelas estimativas da Destrap ele será o líder mundial no futuro, por isso ele deve ser morto, mas novamente os Cybercops entram em ação para impedir.

O satélite Artemis II é reprogramado pela Destrap de modo que possa colidir com a Terra e alvejar a cidade de Tóquio. Com os disquetes do programa modificados, o ZAC terá que pensar em um modo de evitar que um desastre iminente aconteça.

Uma criatura poderosa quer explodir a Central de Computadores e um rapaz desconhecido auxilia os Cybercops. Quem será ele?

Os planos de destruição dos Cybercops não passavam de uma trama para desviar a atenção de um outro plano em andamento. Agora, um terrível plano estava para começar. A cidade de Tóquio estará ameaçada por um perigo jamais visto até agora?

A cidade de Tóquio no ano de 2000 é alvo da misteriosa organização chamada "DESTRAP". Agora a cidade enfrenta uma nova investida de horríveis e perigosas criaturas chefiadas pela sádica Luna.