Um crânio se choca contra o pára-brisa de um carro de um grupo de adolescentes em uma auto-estrada. Ao examinarem o crânio, Brennan e Cam encontram marcar feitas por dentes humanos, o que implica em canibalismo. Com a vítima identificada, Brennan e Booth saem para investigar e se deparam com uma estranha sociedade canibalística. Enquanto isso, Angela e Hodgins contratam um detetive particular para encontrar o marido dela. Zack volta para o Instituto Jeffersonian e descobre algumas provas cruciais para a solução do caso.

Brennan e Booth investigam a morte de uma mulher na explosão de sua mini-van e se perguntam os motivos que alguém teria para matar uma pessoa aparentemente inocente. Pouco depois eles descobrem que a tal mulher, June, integrou um grupo de radicais nos anos 70 chamado Exército Nacional de Liberação. June também era procurada pelo FBI há décadas e poderia estar prestes a se entregar, o que fornece motivos para o seu assassinato realmente complicado. Enquanto isso Brennan visita o pai, Max, na prisão.

A equipe investiga um cadáver em decomposição encontrado na floresta com os braços amarrados e sem os pés. As coisas ficam estranhas quando Booth e Brennan são levados a um albergue usado como refúgio para a prática de sadomasoquismo entre “jóqueis” e seus “cavalos”. Enquanto isso, Angela faz hipnose numa tentativa de descobrir o nome de seu esquivo marido e com isso finalmente se divorciar dele.

Booth e Brennan examinam um cadáver bastante decomposto encontrado por alguns adolescentes no terreno de um hospital. Eles identificam o morto como sendo Franklin Curtis, fundador de uma rede de supermercados de alimentos orgânicos, e descobrem que ele pode ter sido queimado. Quando Booth e Brennan saem para interrogar os vizinhos de Curtis, a equipe encontra carne de outra vítima em Curtis. Booth e Brennan são encaminhados ao psicólogo.

Um labirinto de abóboras decorativas do Halloween se torna ainda mais assustador quando os restos mumificados de uma jovem são encontrados dentro das abóboras. Booth e Brennan partem para a investigação e ficam chocados ao descobrir que a vítima está morta há mais de um ano. Para tornar a situação ainda mais horripilante, um segundo corpo é encontrado em uma das atrações de um parque temático de Halloween, igualmente mumificado, mas desta vez com cerca de dois anos. Booth e Brennan tomam conhecimento sobre uma terceira garota desaparecida e ligam o caso à pessoa que matou as outras duas garotas. Agora, eles precisam correr para encontrar o assassino antes que ele ou ela ataque novamente neste Halloween.

A equipe suspeita de seus próprios colegas de trabalho quando os restos mortais de uma estagiária do Jeffersonian são encontrados no incinerador do prédio. A princípio acredita-se que ela possa ter sido assassinada por estar trabalhando com um artefato do caso do Filho da Viúva. Porém, as coisas se complicam quando é descoberto que a moça mantinha um relacionamento com outro funcionário do Jeffersonian. Enquanto isso Booth banca o namorado de Cam em uma reunião da família dela.

Uma cápsula do tempo enterrada pela turma de 1987 de uma escola secundária é desenterrada por um grupo de ex-alunos. Ao abrí-la, eles são surpreendidos com o corpo de um colega de turma. Booth e Brennan descobrem que a vítima era um estudante rejeitado e investigam o passado dos demais alunos numa tentativa de descobrir o assassino.

O corpo de um arcebispo é encontrado por alguns trabalhadores de uma construção. A rótula do religioso foi removida cirurgicamente, o que leva a equipe de volta ao caso do Filho da Viúva.

Booth e Brennan investigam um papai noel de shopping center que foi encontrado morto por dois duendes. Uma série de pistas faz o tal papai noel parecer real.

Booth e Brennan investigam a cena de um crime e descobrem um corpo que pertence a um famoso corredor de motocicleta que foi assassinado depois de uma corrida. 

Booth e Brennan investigam caso de atleta universitário que foi esmagado atrás da arquibancada do ginásio e suspeitam que se trata de mais de um assassino.

O carro de uma mulher é jogado para fora da estrada e ela morre. No entanto, seu bebê milagrosamente sobrevive ao acidente. Booth e Brennan vão até a cidade da vítima para tentar descobrir quem provocou o desastre. Booth ajuda Brennan a tomar conta do bebê até que a equipe encontre o assassino.

O pai de Brennan, Max Keenan, é levado a julgamento pelo suposto assassinato do ex-diretor do FBI, Kirby. Toda a equipe, com exceção de Brennan, é convocada pela promotoria para testemunhar. Já Brennan, que atua como conselheira forense pela defesa, precisa confiar em sua dedicação à família e sua habilidade profissional para ajudar a inocentar seu pai.

O cantor Tommy Sour é encontrado morto. Entre os vários suspeitos do crime - pessoas que participaram de um concurso de música - está uma mulher que era obcecada por Tommy e que passa a jogar seu charme para Booth. Durante a investigação, um terrível acontecimento deixa a equipe de Jeffersonian chocada.

O assassino serial Gormogon está de volta e o esqueleto de prata do porão desaparece. Todos os funcionários do Jeffersonian se tornam suspeitos. A possibilidade de algum deles estar trabalhando com Gormogon deixa todos assustados.