Antoine fica com ciúmes de Sonic e quer impressionar Sally. Ele chega à conclusão de que a única coisa a fazer é capturar Robotnik.

Sonic está tendo pesadelos com Sally sendo robotizada. Enquanto isso, Sally, Bunnie e Antoine partem em uma missão para impedir que Robotnik crie nuvens de chuva ácida. Quando eles são capturados, Sonic tem que vencer seus medos para salvá-los.

Enquanto se esgueiram por Robotropolis, Sonic, Sally e Antoine encontram Griff, o líder do grupo de lutadores da liberdade de Lower Mobius.

Robotnik ativou o satélite Skyspy para encontrar Knothole. Sonic e Rotor trabalham para tirar o Skyspy antes que seja tarde demais.

Robotnik perturba gravemente o ecossistema acima e abaixo da superfície, quando ele envia sondas de cobra explosivas, Robotnik, perfurando profundamente o solo em busca de lagos de petróleo. Depois de ser levado para um mundo subterrâneo por um redemoinho, Sonic, Sally, Antoine e Robot descobrem uma estranha criatura que afirma ser o último de um povo que foi destruído por criaturas da superfície e culpa os Lutadores da Liberdade por sua situação. O robô tem a chance de se tornar um herói para uma mudança, quando ele salva Sonic e os outros de um pote tóxico de techno-junk, mas cabe ao ouriço virar ...

Tails sempre idolatrava Sonic. Agora ele vai para uma missão com ele.

Tails faz amizade com um bebê Tarapod. Agora, os lutadores pela liberdade devem proteger a família do Tarapod de Robotnik.