Na estreia da temporada, uma nova alcateia de alfas chega para causar estragos na vida de Scott, enquanto Derek e Isaac lutam para localizar Erica e Boyd.

Allison e Lydia tropeçam em uma possível pista para encontrar Boyd e Erica, enquanto um amigo de infância de Stiles desaparece.

Com Boyd e Cora à solta e sob a influência da lua cheia, Scott e Derek precisam recorrer a um aliado incomum para conseguir ajuda.

Enquanto Scott tenta manter Isaac longe de um confronto mortal com os Gêmeos, Stiles tenta provar a teoria de que os assassinatos não têm nada a ver com lobisomens.

Durante uma viagem de ônibus para um encontro nacional, Scott e os amigos relembram um ataque preventivo contra os alfas.

Encurralados, Scott e os outros passam por experiências estranhas que levam a acreditar que eles próprios podem ser os alvos do assassino misterioso.

À medida que o perigo começa a se aproximar de Scott, ameaçando Deaton, seu mentor de confiança e chefe, Kali e os Gêmeos vão atrás de Derek.

Procurando respostas, Scott, Allison e Stiles ouvem histórias de dois narradores improváveis e descobrem um segredo sobre a cor dos olhos de um lobisomem.

Enquanto Allison começa a suspeitar de alguém muito próximo dela, Scott e Stiles descobrem que os novos talentos de Lydia podem resolver os assassinatos.

Presos em um hospital de Beacon Hills evacuado por uma forte tempestade, Derek e Scott precisam defender-se dos Alfas, enquanto tentam salvar a vida de Cora.

Com a ameaça ficando mais pessoal e o tempo se esgotando, Scott faz uma escolha difícil para salvar amigos e família, enquanto Derek e Peter tentam salvar a vida de Cora.

Seguindo o conselho de Deaton, Scott e seus amigos usam um antigo ritual para salvar as vidas das pessoas que amam e impedir que Deucalion alcance seu objetivo sinistro.

Scott, Stiles e Allison apresentam estranhos efeitos colaterais após o ritual de sacrifício. Enquanto isso, Stilinski revisita casos do passado.

Um aliado inusitado aparece para ajudar Derek e Peter. Enquanto isso, Scott e seus camaradas tentam capturar o coiote.

Scott e seus amigos são obrigados a entrar em ação quando um assassino condenado escapa da custódia na véspera do Halloween.

Beacon Hills está sob toque de recolher, e os jovens fazem uma festa de Halloween à luz negra. Enquanto isso, Scott tenta ganhar a confiança de Kira durante um ataque.

Enquanto os amigos de Scott tentam protegê-lo dos ninjas demoníacos, Stiles pede que Melissa o ajude a descobrir o que está acontecendo com ele.

Stiles desaparece no meio da noite, e Scott e a turma iniciam uma busca desesperada por ele. Enquanto isso, Lydia tenta aprender a controlar suas novas habilidades.

Com indícios de sabotagem por toda parte, Scott e a turma tentam descobrir como evitar um desastre.

Enquanto Scott e seus amigos procuram por um artefato japonês essencial, Stiles precisa fazer uma escolha difícil em um hospital psiquiátrico.

Uma história contada pela mãe de Kira sobre um campo de concentração nipo-americano durante a Segunda Guerra Mundial fornece uma pista crucial para derrotar o inimigo.

Scott e Lydia se unem em um esforço desesperado para ganhar vantagem. Enquanto isso, Stilinski enfrenta um comitê de ética.

Atingidos por um desastre e prestes a serem derrotados, Scott e Derek reúnem seus aliados para uma última batalha.