Natsu e seus amigos partem para um novo continente para fazer a Missão de 100 Anos, uma missão que jamais foi concluída por nenhuma outra guilda e foi proposta pela primeira guilda, Magia Dragon.

Natsu e seus amigos chegam em Ermina e descobrem algo suspeito ao passarem uma noite no hotel. Enquanto isso, na Fairy Tail, enquanto as suspeitas sobre Touka aumentam, Jellal aparece em sua procura.

Em meio à batalha de Natsu e seus amigos contra Kiria e Madmall, o mar se abre e aparece Mercphobia, o Deus Dragão da Água. Mas ele será um amigo ou inimigo?

Jellal encontra Touka, a Maga Branca, mas quando consegue confrontá-la, ela é protegida por Laxus. Enquanto isso, Erza, Natsu e Wendy são feitos de prisioneiros. Cabe a Lucy fazer o possível para salvá-los!

A Fairy Tail prende Touka depois de descobrir que ela tinha uma dupla personalidade e era realmente a Maga Branca. Enquanto isso, Natsu e seus amigos encaram os comedores de dragão.

Mercphobia, o Deus Dragão da Água, perde o controle e sobe o mar para o céu. Natsu e seus amigos precisam juntar suas forças para derrotá-lo. Mas será que o fogo de Natsu será capaz de derrotar a magia de água? No meio da batalha, aparece alguém no mar no céu. Será um amigo ou inimigo?

Natsu e seus amigos conseguem derrotar Mercphobia e salvar a cidade que ficou à beira da destruição. Agora eles precisam seguir para o próximo ponto da sua jornada, mas por onde eles devem começar?

Natsu e seus amigos conhecem a guilda com seus sósias, a Fairy Nail. Em seguida partem em busca de Aldoron, o Deus Dragão da Madeira, e segundo no caminho para cumprir a missão de 100 anos.

Natsu e companhia descobre a verdade sobre o que aconteceu com seus companheiros de guilda. Agora eles precisam fazer o possível para trazê-los de volta enquanto a Maga Branca avança com seu plano.

Ao mesmo tempo que se descobre o plano da Maga Branca, Natsu e seus amigos se veem encarando seus colegas de guilda. Com as batalhas ficando mais intensas, novos inimigos também aproveitam para entrar na batalha.

Ao mesmo tempo que precisam lutar contra seus amigos, Natsu e companhia ainda encontram os membros da Diabolos. Natsu encara Wraith e, aparentemente, é morto após ele tirar a alma de seu corpo.

Wendy encara Nebaru, mas logo ele resolve destruir o orbe. Em meio a isso, Laxus batalha com Kiria em frente a outro orbe. Natsu encara Makarov, que foi tomado pelo espírito de Wraith.

Erza luta contra Laxus para impedir que o orbe seja destruído. Enquanto isso, Natsu e Happy encontram Touka e se aproximam um pouco mais da verdadeira identidade dela.

Enquanto Natsu e Happy descobrem a verdade sobre Touka, Wendy luta contra Nebaru. Os demais membros da Diabolos começam a fugir, mas Nebaru resolve liberar seu verdadeiro poder. Será que Wendy conseguirá derrotá-lo?

Todos os orbes de Aldoron são destruídos. Mas algo não deu certo nos planos da Maga Branca e, de repente, todos da Fairy Tail começam a recuperar o controle dos seus poderes.

Quando acharam que a Maga Branca derrotaria Aldoron, algo surpreendente aconteceu. Agora a Fairy Tail precisa lutar contra as cinco God Seeds, que compõem o Deus Dragão da Madeira.

Enquanto Natsu encara Aldoron, seus amigos lutam contra seus homens. Gray e Juvia contra Metro e Jellal contra Gears. Mas será que eles conseguirão vencer para reduzir o poder do Deus Dragão da Madeira?